0.准备输入数据 可以是矩阵 行是一边，列是一边，矩阵正文的数字表示连接的强度。 可以是tidy数据框 一行是一个连接关系，第一列和第二列是要连...
投稿
收录了208篇文章 · 368人关注
-
弦图，管他中不中用，反正高大上 -
想自己搭建服务器，永久运行网站？一个 U 盘大小的树莓派就够了！
No.1 前言 由于本人在这段时候，看到了一个叫做树莓派的东东，初步了解之后觉得很有意思，于是想把整个过程记录下来。 No.2 树莓派是什么？ ...
-
使用IGV简单绘制甲基化分布图废话不多说，直接简单粗暴的开始吧 导入基因组 导入基因组文件：Genomes→load geome from file→选择"reference...
-
群体结构——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也称主分量分析，旨在利用降维的思想，把多指标转...
-
计算bam文件中比对上基因组的reads以及合并多个bam文件
参考文章：1.如何统计BAM文件中的reads数2.Samtools常用命令的总结 当你有很多个bam文件时，想知道这些bam文件里有多少个比对...
-
序列比对后计算变异位点，有效位点，核苷酸多样性variable sites informative sites nucleotide diversity 信息位点的定义：在两个及以上分类单元...
-
读文章重复结果：使用DnaSp软件计算核苷酸多态性Pi(nucleotide diversity)
叶绿体基因组的文章中通常会有一小部分内容是运用DnaSp软件来进行核苷酸多态性π分析，断断续续看了也好长时间了，今天终于重复出了结果，简单记录自...
-
根据vcf文件计算SNP密度并用circlize可视化结果参考 收集vcftools所有用法 命令 100000 是指定窗口长度--out 是输出文件的前缀 使用R语言中的circlize包画图 参考 ...
-
全基因组关联分析（GWAS）学习笔记——3.1参考资料 https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/ 全基因组关联分析学习资料（GWAS tutoria...
-
如何利用NR库快速进行物种鉴定
作者：charon审稿：童蒙编辑：angelica 引言 在做基因或者蛋白质功能注释的时候，NR数据库包含非常重要的信息。但是有没有人跟我一样遇...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/557754/timg.jpeg', '推荐专题《生信相关》（ 分享自 @简书 ）','https://wsa.jianshu.io/c/273c552ffaf4?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}