上篇说道，这本书以书楼为戏台，上演了六出折子戏，前三位主演已然登场唱罢，现在，轮到剩下三位登台。
替天行道，
究竟是否算是正义？
如若错了，
又该如何赎罪？
一名老者，带着一位声称是“死人”的朋友，来到吊堂，希望书楼主人能够推荐一本书，以救赎他这位朋友。
“虽生尤死，活着对他来说就是一种苦，可却不能死。”
这名“死者”究竟是有何种遭遇而至于此？
在那个战乱的时代，每个人都因自己的理念、梦想而相互叫嚣、讨伐，甚至打着“天诛”的旗号，互相残杀。“死者”名为冈田以藏（1838-1865），日本幕末四大斩人之一，挥舞着天诛之剑，号称稀代的暗杀者。
在为主公的理想扫除障碍的过程中，他不断以天诛的名义杀死政见不同者。然而，在正义之剑的纷乱挥舞下，他的心却开始动摇，不明白自己所做的一切到底是否是正确，开始反思自己的行动，并最终决定放下天诛之剑，选择自首，告知衙门一切，以保全身边人。可惜世事难料，他虽顿悟，天诛不过是把自己所犯之罪、接下来要犯之罪，通通归咎于天的卸责之词，然更多人却在时代的裹挟下，挥舞屠刀，砍向那些与己不合之人。结果，他的身边人均因他的坦白而死，而该死的他，却是被迫活了下来。衙门对外宣称这位天诛高手已死，在世人眼中的他，已然是个死人，而他也因极度的内疚，生不如死，犹如行尸走肉般的生活。
听完他的故事，书楼主人告诉他“拥有崇高的思想是不错，忠、孝、礼、义，还有政治当然都很重要，但对于要如何活下去，要达成什么目标而思考、烦恼，也很重要”，并卖给了他一本关于人体解剖学的书——《重订解体新书》，希望他能了解人的死亡，进而确定自己是活着的，并重新开启新的人生。
庆应四年，死人“冈田以藏”的名字，再次出现在公众视野中，有人称他在一次暗杀活动中曾保护那位老者，让人不禁疑惑，为何一个已死之人还在世间活动，究竟是重名，还是弄错了？看来，他确是找到了活下去的希望，只不过他接下来的人生如何，便无人知晓……
向左走，
或是向右走，
正确的那条路，
究竟是哪边？
在从泉镜花处听说了吊堂这间书楼后，一位客人慕名前来，以求一本一辈子的书。不过，与其他人不同的是，他已然找到了属于自己的那本书，只是之前的那本已破旧不堪，想寻一本新的，继续保存。
虽已是著名童话作家的他，却也有自己的困惑。他称自己是个“外形硕大的小孩子”，怎么也甩不掉稚拙的感觉，且一直沉溺与回忆过去，总觉得自己是在逃避现实，觉得写童话不过是因为自己只能写这种给小孩子看的东西而已，写不出东西，内心十分迷茫、纠结。
“如果心中没有正反，那么，不论你朝哪个方向走，都算不得是错了，都一样是在往前的。”书楼主人的一席话，让人醍醐灌顶。他的纠结，不过是因为自己觉得要去的目的地不在那里，才会觉得方向不对。其实，人生中走哪条路都一样，只要一直走下去，别走岔了，总有一天会走到一个目的地，即使心中没有设定目的地，也一定是会走到某个地方。
最终，书楼主人在帮他找到想要的那本书之于，还送给了他一套专讲民间故事的书——《御伽草子》，故事一直是口耳相传，且多得数不胜数，没有尽头，也就不会没有阙如（存疑不言），可以一直、一直的写下去……
这位客人便是日本著名童话作家、小说家岩谷小波（1870～1933），而后的他创办了一系列儿童文学杂志，成为日本近代儿童文学的开拓者和集大成者。只是无人知晓，因何他最后会编纂一套关于日本传说故事的大部头。
活着这回事，
一直都是未完成，
而未完即是没有结束，
也就是永远。
这一出戏，发生在书楼吊堂之外的一座神社——武藏晴明社。
书楼主人邀请高远，一同前往武藏晴明社收书，收购的都是前任宫司的一位老友几十年来的藏书。不过，在准备离开时，书楼主人却留下了一些“活着”的书，希望现任宫司中禅寺辅可以继承父亲遗志，以适合现代的形式，将这些未完成的“活”书进行改写。
“以文字记录的事，全都不是真实；从当中汲取事实的，是读者”。虽然这些书中的内容在现任宫司看来都是些迷信、虚妄，都是些不存在的东西，但它们是传统，而传统“应该延续下去，为了延续下去，非改不可。若是不与时俱进，即是死物”。
故事的最后，高远买了书楼主人推荐的一本未完的书，而在这次收购书的过程中，他终于知道了书楼主人的姓氏：龙典。
这位神秘的书楼主人背后，究竟隐藏着怎样的故事，恐怕只能看下一部《书楼吊堂：炎昼》才能知晓了……
