数据量计算:重测序数据 .fq 格式,wc -l 计算出 行数/4 * 150 =数据量。
参考:
另外,miRNA测序,只需要10M read,每条read长50bp,单端测序。
ChIP-seq,需要20M read,每条read长50bp,单端测序。
销售只说多少G,不说reads数,如何把reads数换算成G呢?
这跟测序长度有关:
PE150或2*150,即双端测序,每条read长度150bp。
150bp X 2端 X read数 = 数据量
例如,测50M read,150bp X 2端 X 50M read = 15000M = 15G
注:对于双端测序,一个RNA片段,即fragment,也叫read,会测出来2条序列。
SE50或1*50,即单端测序,每条read长度50bp。
50bp X 1端 X read数 = 数据量
例如,测20M read,50bp X 1端 X 20M read = 1000M = 1G