part1:向量
-1.标量和向量的区分
首先明确“元素”的意思,元素指的是数字或者字符串(用chr表示)等,根据它可以区分两个词:
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变(补充:一个向量是一排有序排列的元素,以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。)
补充:一个向量是一排有序排列的元素,以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。)
理解元素、向量和标量
使用时,一般都会直接给变量定义,也就是“赋值”,字面意思是赋予这个变量一个数值(其实也不一定是数值,还可以是字符串/数据框等等.
怎么看变量
2.从向量中提取元素
(1)根据元素位置
#这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改x[4] #x第4个元素x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素x[2:4]#第2到4个元素x[-(2:4)]#除了第2-4个元素x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
(2)根据值
x[x==10]#等于10的元素x[x<0]x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
Part2:数据框
将示例数据放在你的工作目录下(!!!重要)
示例数据是如何获得的?(可跳过)
(1)新建doudou.txt,输入以下(如果教程里让你新建,又没说在哪里,你就默认在工作目录下新建。)
X1,X2
A,1
B,
C,
D,3
E,
小抄截图中显示的NA表示空值,所以新建的时候像我一样空着就好。用以下命令即可获得示例数据框:
X<-read.csv('doudou.txt')
(1)读取本地数据
(huahua.txt在示例数据里有,记得一定要放在工作目录里,否则报错。)
[图片上传失败...(image-807b53-1616739404942)]
sep,header是比较常用的参数,可以看帮助文档尝试理解它们的意思
(2)设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框colnames(X) #查看列名rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
(其实我们这个数据框并不需要改,如果你已经改了,知道怎么撤销吗?用刚才的read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖掉你刚才改瞎的了。这也就是变量为什么叫"变"量)
嗯。我故意写了个大写的X,就是告诉你一下大小写是严格区分的,耶。
(3)数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
(4)变量的保存与重新加载
#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
(5)提取元素
(这里的X是的刚才的变量名,实际应用要懂得替换。刚才让师姐测试我教程的时候很担忧你们粗暴地复制我的代码,最后啥也没看懂。)
- X[x,y]#第x行第y列- X[x,]#第x行- X[,y]#第y列- X[y] #也是第y列- X[a:b]#第a列到第b列- X[c(a,b)]#第a列和第b列- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
(6)【选修部分】直接使用数据框中的变量
提取某两列作散点图:
(需要提示一下,这里的case和values是两个单纯的列名,没别的意思)
options(stringsAsFactors = T)a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))plot(a$case,a$values)
--这种方法有个缺点:数据框名a在代码中重复出现(不符合懒惰(哦不,高效)的要求)
这里地数据框名比较简短,可能你看不出不够优雅,本着花花懒惰的强迫症精神,不能允许数据框名出现两次。(如果你不够懒惰,下面的代码别看了,会瞎的)
那么如何懒惰地实现:
方法1:attach
- 将数据框名添加到搜索环境中:attach(a),作图时就只需输入列名(连$都不用了)。
attach(a)plot(case,values)
做完后将a删除出搜索环境 detach(a)
局限性:两个以上数据框的列名有冲突时,同时attach会报错。
方法2:with
with(a,{ plot(case,values)x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量,也就是出了大括号仍有效。})x #运行完后打印x
简单查一下什么是with哦?这并不是一个必学的知识点,只是作为补充。
由于昨天没有用到脚本窗口,这里正好学习一下脚本的使用和保存:将上面的代码复制(手打更好)到一个新的R脚本中。
然后保存到工作目录下,打开.
请注意脚本文件的后缀就是R,在R语言里还是很在意后缀的。很多复杂的代码都是大神写的,就是以脚本的形式给你,要用的时候直接找到他,用Rstudio打开就好。
问题
1.X的大小写是否一致;
2.file中是否有X数据的存在。看数据对错,数据和代码中的X大小写是否相同。
感悟:在R语言使用过程中,应当注意代码大小写及标点符号的使用。一般应当使用英文格式的标点符号。