初看《冲锋车》的海报时，被漫画式却冷酷的风格误导，以为又是一部枪弹雨林英雄情结非常严重的类型电影。双线却非线性的叙事结构，暖黄色基调，漫画式夸张的镜头表现手法以及被放大而紧张的节奏感都似乎在向众人宣告着本片的与众不同，注定了本片必将成为近几年的港片中的一朵“奇葩”。
伴随着蟑螂横行对香港社会造成严重危害的广播新闻，吴镇宇饰演的“发哥”卢西发的嚣张出场，从吉隆坡监狱顺利出狱。自恋到出狱前还不忘对着镜子欣赏自己的好身材，感叹自己多年未变，依旧可以对狱警那番“你没变，但这个世界变了，你不认识这个世界，这个世界也不认识你，只有你认识你自己”的言论不以为然。所以，才会自信满满地将想了十六年的点子说与弟兄们，就算起初是遭到质疑的，他仍能坚定地拍着胸脯跟人说他想的点子绝对不会与人撞车。
四兄弟协作配合，发挥各自的优势与技能，偷零件，将小巴改装成冲锋车，立马实施了冒充警察，拦截出入境运尸车，趁机打劫藏在尸体内钱财的“黑吃黑”计划。
满腔热血地准备干一番“大事业”，计划的实施却并没有如发哥等人所想的那样顺利。影片跳出了以往大多数的港片人物设定上的悲情英雄模式，导演选择在将坏人形象刻画得入木三分的吴镇宇等人担任故事的主角，可见是想与观众玩个大反转。好在实力派演员终不会让观众失望，吴镇宇一改往日“靓坤”张扬跋扈，卢西发看似狂妄实则一只纸老虎，任达华昔日大哥风光黯淡，饰演丧宝任人宰割，谭耀文假装风流实则连自己的女人都搞不定，郑浩南毫无主见且胆小怕事，几个各有特色却徒有虚表的矛头小贼偏要做“江洋大盗”的梦。
纵然穿上了一身警服，也不忘流露出黑帮神态，迅速进入角色，希望坏人做到底。却因心中善良不灭，第一次查车，就解救了被强暴的卖雪糕少女。在路上遇到了运送尸体的运尸车，准备将尸体里的钱劫走时，又冒出另一辆警车。
见警车里的人拿着AK47一顿乱扫，将运尸车上的几人打死，同样盯上了尸体里的钱财。疑云种种中，发哥他们才恍然大悟，他们冒出警察打劫的桥段居然毫无预兆地与人撞车了！
手持AK毫无人性的悍匪见人就杀，紧急关头任达华饰演的阿宝救下一个走丢的小女孩。当几兄弟安全返回小巴时，才发现车上不仅多了让他们救回来的小女孩，还多了个女人。直到另一帮悍匪打电话过来，发哥他们才知道自己兄弟在悍匪手里，其中一个悍匪的女人在自己手里。
一面是拿着AK杀人不留情的悍匪，一面是兄弟之情，究竟是抢钱为大还是人齐开车？三兄弟因为是否前往交易地点交换人质发生争执。再加上还要一路上照顾走丢女孩，使得局面更加混乱。
最后发哥带着劫匪的女人开车扔下兄弟而去，丧宝带着小女孩等公交车，懦弱的阿东第 一次向兄弟说“不”，拒绝再玩。可是，离开兄弟的几人，都迷失在了黑夜里。他们不知道自己能去哪儿，其中几人各自经历再次险遇悍匪、与买雪糕少女重逢，冲锋车被古巨基饰演的警察徐安良拦截下来。他们认清了自己，找到了前进的方向。
几人几经周折将自己的兄弟救回，当大家再次聚集在一起时，谭耀文饰演的仲尼才坦白自己本打算独吞尸体了的钱财，没想到大家会拼命回去救他，而发哥也坦言自己曾经在金钱和兄弟面前选择了钱，不过现在已经不重要，从他们救下仲尼时，“人齐开车”早已敌过“抢钱为大”。
重聚一起的四人为了不让更多人死于悍匪枪下，决定开着冲锋车追击悍匪。生锈的四只冲锋枪、四个保龄球抓住了五个扮警察打劫的贼，还帮助徐安良找回了丢失的警帽，小巴的最后一站开往警局，四人自首。
故事另一条线则是一直在“除暴安良”的路上努力的徐安良，曾在黑帮组织里做卧底，不能暴露身份所以伪装成小巴司机，在一场车祸劫后余生后选择回到警局穿上制服。他迷茫，卧底身份让他每天怀疑着自己所做事情的意义，为了证明身份解开心中顾虑，他选择警衣警帽。他的哥哥却告诉他，其实穿什么不重要，重要的是当警察，无论何时都要有一颗抓贼的心。
直到后来徐安良遇上发哥他们，一群“贼”穿上警服去打劫遇上另一伙穿警服打劫的贼，其中一伙看不惯对方视生命如草芥，展开追击想要替天行道。徐安良感叹这个世界很奇怪，龟苓膏没龟，奶茶没奶，坏人不坏。所以，受伤的他放心地让发哥他们去救兄弟，坚信小巴的最后一站一定会开往警局。
当发哥他们履行承诺，回到警局，并为他找回了警帽，也再次向徐安良证明了，这个世界并非非黑即白，不是所有的贼都穷凶恶极。原来穿什么真的不重要，重要的是有一颗想要当英雄的心。如发哥等一群“笨贼”与拿着AK的悍匪，同样假冒警察，开着冲锋车，发哥等人不仅虽然无意却一直在救人，与草菅人命的悍匪形成鲜明对比。
随着发哥等人的自首再到出狱，所有的一切都归于平淡，广播中播放着制造蟑螂灾害的始作俑者被抓的新闻，与片头首尾呼应，看似与此片毫无联系，却有着深刻的隐喻。也许我们每个人心中都有一块蟑螂能够寄予存活的地方，每个人都有不为人知的阴暗面，但只要心存一丝善念，邪恶终不会继续蔓延。
卢西发与兄弟说又想到了一个新点子，要伪造一艘军舰夺回属于我们的岛屿，虽然言语中极具黑色幽默和搞笑成分，主意还是得到兄弟们的支持。
在经历种种之后，徐安良选择了继续开小巴在黑帮组织里当卧底，有一颗肩负警察使命和责任的心，穿什么都不重要。超人终究是超人，不管它有没有内裤外穿，依然能够拯救世界。而他徐安良，不管身在何处，定会为除暴安良贡献力量。
