如何快速了解接触的质粒(四)

会读质粒图才能用好质粒。

前面部分稍微复杂一点的启动子和复制子已经大概介绍完了,后面会慢慢补充遗漏的小知识点,这一part是相对简单但是对于克隆筛选非常重要的----抗性基因。

       抗性基因是一段已知功能或已知序列的DNA片段,起到特异性标记的功能。使细菌对氨基苄青霉素,氯霉素等抗生素产生抗性,利用此来判断基因表达载体是否成功导入细胞内。


pUC19 质粒图谱

pcDNA 3.1(+)质粒图谱

上面质粒图谱中圈出的AmpR,NeoR/KanR等表示质粒中抗性筛选标签,方便后面筛选出阳性克隆(重组成功的阳性质粒;自连的假阳性质粒需要后续质粒测序验证)。抗性基因可以参考用来区分质粒的种类,像复制起点一样,质粒中有两个复制起点一般为穿梭质粒;类似的质粒中有两种抗性基因一般为穿梭质粒(pcDNA3.1(+))。

抗生素可以买粉末选择合适浓度和溶剂自己配制,也可以购买现成抗生素按照说明书上比例稀释直接使用即可。注意为了保证长期保存,常需要过0.22μm滤膜,避光;分装;-20°C冷冻保存。

01

原核抗性

下面是常用于原核生物的抗生素

02

真核抗性

新霉素(Neomycin)/G418

        新霉素是一种氨基糖苷类抗生素,能够结合到细菌核糖体 30S 和 50S 亚单位引起 蛋白错误编码,在蛋白合成期间抑制起始和延长,对革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌均 有效,尤其是对金黄色葡萄球菌、白喉杆菌和炭疽杆菌作用更有效。与卡那霉素有完 全交叉抗药性,与链霉素有部分交叉抗药性。

        新霉素的使用浓度跟细胞培养方式、细胞种类、载体 DNA 有关。悬浮培养细胞更敏感,使用浓度低,贴壁细胞使用浓度高。硫酸新霉素工作浓度 范围为 100~1000 µg/ml。

    2. 嘌呤霉素(Puromycin Dihydrochloride )

        Puromycin是来源于Streptomyces alboniger的一种氨基核苷类抗生素,中文名为嘌呤霉素,常用于筛选通过质粒转染/转化、病毒感染等方法能表达pac基因(puror)的真核或原核多克隆或单克隆细胞。Puromycin不仅用于稳定细胞株的筛选,也用于稳定细胞株的维持。Puromycin的特点是快速作用于细胞,一般2天内可以杀死99%的不表达pac基因的细胞。

    3. 潮霉素B(Hygromycin B)

        Hygromycin B(潮霉素B)是来源于吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus)的一种氨基糖苷类抗生素,对细菌,真菌和哺乳动物细胞均有抑制作用和细胞毒性。

        Hygromycin B(潮霉素B)通过干扰蛋白翻译过程中70S和80S核糖体易位,诱导对mRNA模板的错误翻译而抑制细胞蛋白质的正常合成,从而导致细胞死亡。

        大肠杆菌来源的Hygromycin B抗性基因(hyg或hph)所编码的Hygromycin B磷酸转移酶可将Hygromycin B磷酸化,导致其失去活性,从而起到解毒作用。因此,Hygromycin B可用于筛选成功转染了Hygromycin B抗性基因的原核或真核细胞。

    4. 博莱霉素(Zeocin )

        Zeocin即phleomycin D1,中文名称博来霉素或者腐草霉素D1,是从轮状链霉菌(Streptomyces verticillus)的一个突变体菌株中分离而来的博来霉素/腐草霉素(bleomycin/phleomycin)的抗生素家族成员。它对细菌、真菌(包括酵母)、植物和哺乳动物细胞均有抑制作用和细胞毒性。

        Zeocin是一种碱性、水溶性的、铜离子螯合的糖肽抗生素。Cu2+螯合的Zeocin溶液呈现蓝色,无活性。当其进入细胞后,Zeocin上的Cu2+被还原为一价铜离子(Cu+),并被细胞内的巯基化合物(sulfhydryl compound)清除,导致Zeocin被活化,能够结合到细胞内DNA上并使其断裂,最终导致细胞死亡。

        上面是原核生物和真核细胞中常用到的筛选抗生素,可以根据实验需要寻找合适的抗生素,这一部分就先讲到这里。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 199,902评论 5 468
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 84,037评论 2 377
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 146,978评论 0 332
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 53,867评论 1 272
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 62,763评论 5 360
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,104评论 1 277
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 37,565评论 3 390
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,236评论 0 254
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,379评论 1 294
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,313评论 2 317
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,363评论 1 329
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,034评论 3 315
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,637评论 3 303
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,719评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 30,952评论 1 255
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 42,371评论 2 346
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 41,948评论 2 341

推荐阅读更多精彩内容