参考自 https://www.biostars.org/p/64346/
方法: 利用UCSC的bedToGenePred和genePredToGtf进行转换 下载可以用conda下载
bedToGenePred combined.bed /dev/stdout| genePredToGtf file /dev/stdin combined.gtf
#gtf第二列可以改个名字 下面就是改成new
sed -i 's/\/dev\/stdin/new/g' combined.gtf
参考自 https://www.biostars.org/p/64346/
方法: 利用UCSC的bedToGenePred和genePredToGtf进行转换 下载可以用conda下载
bedToGenePred combined.bed /dev/stdout| genePredToGtf file /dev/stdin combined.gtf
#gtf第二列可以改个名字 下面就是改成new
sed -i 's/\/dev\/stdin/new/g' combined.gtf