一般我们做数据分析,通常是在自己电脑上远程登录服务器,通过nohup运行脚本让任务保持非挂起状态运行,以及忘记nohup之后使用disown将任务切换为nohup状态,但如果每条命令都使用nohup实在是比较麻烦。但这样也比较麻烦,所以有了更好用的screen和tmux,最新且功能更强的是tmux,现在我已经不经常使用screen,而全面转向tmux。
应用场景
网络不稳定,经常掉线,导致任务经常中断;
使用网络下载数据,例如wget或者prefetch后台下载比较大的数据;
下班后,退出ssh登录,关机走人,任务忘了切换到nohup模式;
需要使用nohup的场景。
tmux
tmux(terminal multiplexer)是Linux上的终端复用神器,可从一个屏幕上管理多个终端。使用tmux,用户可以连接或断开会话,而保持终端在后台运行。也就是登录Linux之后,开始tmux,之后所有的操作都在tmux中完成,这样即使突然掉线了,所有的任务都还在tmux之中。
tmux的结构包括会话(session)、窗口(window)、窗格(pane)三部分,会话实质是伪终端的集合,每个窗格表示一个伪终端,多个窗格展现在一个屏幕上,这一屏幕就叫窗口。tmux的操作主要包括对会话、窗口、窗格的创建、关闭、重命名、连接、分离、选择等等。
其实使用tmux并不复杂,虽然tmux有非常多的功能,但是我们主要就是掌握一些基本快捷键就行。
1 软件安装
ubuntu
apt install -y tmux
centos
yum install -y tmux.x86_64
bioconda
conda install -y tmux
2 软件使用
在命令行直接输入tmux,就会自动打开一个新窗口,这个就是tmux的虚拟终端,可以说是伪终端。注意最下面多了一条绿色的状态栏,表示当前一个新终端里。接下来就可以在这个终端中运行任务了。这个任务就一直待在这个虚拟终端中,即使突然掉线了,还可以恢复任务,可以继续运行。
3 快捷键
使用tmux需要经常使用快捷键,其中最常用的就是ctrl+b,因为Linux shell下很多快捷键都被占用了,只能这样操作了,每次先按一下ctrl+b,在使用对应的快捷键。注意ctrl+b是在tmux窗口中使用,在原始的shell命令行下不管用。下面列出一些最常用的快捷操作:
ctrl+b ? : 显示快捷键帮助
ctrl+b d : 脱离当前会话;这样可以暂时返回Shell界面,输入tmux attach能够重新进入之前的会话
ctrl+b 空格键 : 采用下一个内置布局,这个很有意思,在多屏时,用这个就会将多有屏幕竖着展示
ctrl+b ! : 把当前窗口变为新窗口
ctrl+b " : 横向向分隔窗口
ctrl+b 上下键: 上一个及下一个分隔窗口
ctrl+b & : 确认后退出当前tmux
ctrl+b c : 创建新窗口
ctrl+b n : 选择下一个窗口
ctrl+b l : 最后使用的窗口
ctrl+b p : 选择前一个窗口
ctrl+b w : 以菜单方式显示及选择窗口
ctrl+b s : 以菜单方式显示和选择会话。
ctrl+b t : 显示时钟。然后按enter键后就会恢复到shell终端状态
tmux案例
接下来我们演示一条,使用tmux下载生物数据的案例。
#1 新建会话,命名为wget
tmux new -s wget
# 2 运行命令
wget -c ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/swissprot.gz
# 3 按ctrl+b,然后字母d,退出会话,任务仍在运行
$ tmux new -s wget
[detached]
#4 tmux ls查看任务
$ tmux ls
wget: 1 windows (created Wed Jul 24 10:22:34 2019) [114x26]
#5 重新进入wget终端,第一个参数a也可以写成attach,任务正在运行
tmux a -t wget
# 6 关闭会话任务,如果在会话中使用ctrl + d,或者exit,就会在退出会话,也关闭了该会话
# tmux ls查看会话
$ tmux ls
#7 kill-session杀死会话,每个会话成为一个session
$ tmux kill-session -t wget
#8 关闭所有会话
$ tmux kill-server
多窗口管理
如果一次创建了多个会话,tmux还可以对这些窗口进行管理,其实这个xshell自带这个功能,使用xshell更加方便。下面列出一些快捷键,感兴趣的可以尝试一下,首先还是在窗口中按ctrl+b,然后使用对应的快捷键。
ctrl+b ” : 将当前面板平分为上下两块
ctrl+b % : 将当前面板平分为左右两块
ctrl+b x : 关闭当前面板
ctrl+b ! : 将当前面板置于新窗口;即新建一个窗口,其中仅包含当前面板
ctrl+b Ctrl+方向键:以1个单元格为单位移动边缘以调整当前面板大小
tmux翻页功能
tmux类似vim,打开一个新窗口,默认在tmux中鼠标一些功能受限,例如翻页功能。一种解决方案是使用快捷键,例如先按“ ctrl +b, [”,接下来使用鼠标即可实现翻页,然后按q退出。
另一种方法是可以通过设置进行调整。在家目录下创建一个配置文件,然后加入下面语句即可。
# 添加配置文件
vim ~/.tmux.conf
# 在文件中加入下面设置,保存退出
set -g mouse on
不过这样设置之后,会导致鼠标数字粘贴功能失效,可以在复制粘贴的时候使用按住shift键完整鼠标选中复制功能。这两种方案都行,但鼠标复制粘贴一般使用更频繁,建议翻页使用快捷键吧。tmux还有更多好用好玩的功能,可以查看tmux文档。