建成后的大报恩寺为江南三大寺之一,是全国最大的讲寺,一度成为管理全国佛教事务的僧录寺所在地。
如果将大报恩寺比喻为一顶璀璨的皇冠,那么琉璃塔无疑是这顶皇冠上最熠熠生辉的明珠,在它存在的400多年中,中国没有其它任何一座建筑可以与之比肩。
然而,非常令人痛惜的是,大报恩寺琉璃塔这一旷世杰作最终毁于400多年后的太平天国“天京内讧”
1856年,北王韦昌辉因为担心翼王石达开占领城外的琉璃塔,架炮攻击城内,于是派兵在塔下挖地道引爆炸药,一面用火炮直接攻击塔身。最终琉璃塔化作一堆瓦砾,大报恩寺的其他建筑也在大火中一并烧毁。