前言：
这是一篇可以归纳与纯生信的文章，做转录组数据分析都适用学习，基础型文章。这篇文章发表期刊：MBC Genomics，属于二区期刊。我大体看了一些文章，内容算是比较简单的，主要亮点还是他们自己构建一个鉴定LncRNA，Novel mRNA及CircRNA的自动化分析工具（NLncCirSmk）。本文中共鉴定了12817个lncRNA和8320个novel mRNA，并对差异lncRNAs进行WGCNA分析，挖掘出5个关键的lncRNAs，构建由lncRNA-MSTRG.8888.1介导的玉米盐耐性调控通路等相关分析，同时还发现MSTRG.8888.1受上游miR827的调控。详情可以查看原文，代码部分可以查看GitHub中的相关介绍。
本人从学生信开始也是做lncRNAs分析，从最开始的生信平台的搭建（服务器平台环境搭建）都是自己完成的。确实是走过很多的弯路，记忆最深的是刚开始自己不会安装服务器的软件，左磨右泡的弄了很长时间。我看到这篇文章GitHub中的相关教程，对初学者还是比较友好的。因此，推荐大家到GitHub中详细查看相关教程。
代码GitHub：https://github.com/Alipe2021/NLncCirSmk
文章题目：Integrated analysis of long non-coding RNAs and mRNAs reveals the regulatory network of maize seedling root responding to salt stress
视频网址：
01-- 文献分享 | 长链非编码RNAs(lncRNAs)分析流程 | 转录组分析流程 - 知乎
02-- 文献分享 | 长链非编码RNAs(lncRNAs)分析流程 | 转录组分析流程-公众号
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