R语言学习笔记
R语言常识部分
- R语句由函数和赋值构成。 R使用 <-，而不是传统的 = 作为赋值符号。
- 寻求帮助
- 向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串。
- 表格在R语言中改名叫数据框
- 显示工作路径 getwd()
设置工作路径 setwd("C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata")
注意斜杠方向
R将反斜杠（\）作为一个转义符。即使在Windows平台上运行R，在路径中也要使用正斜杠。
函数setwd()不会自动创建一个不存在的目录。如果必要的话，可以使用函数dir.create()来创建新目录，然后使用setwd()将工作目录指向这个新目录 - R拥有许多用于存储数据的对象类型，包括标量、向量、矩阵、数组、数据框和列表。
向量（vector）👈重要
矩阵（Matrix）
数组（Array）
数据框（Data frame）👈重要
List
向量
- 标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
向量是用于存储数值型、字符型或逻辑型数据的一维数组。执行组合功能的函数c()可用来创建向量。
x<-c(1,2,3) #常用的向量定义写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。
x<-(1:10) #从1-10之间所有的整数
x<-seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意这里是逗号不是分号）
x<-rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次
从向量中提取元素
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
根据值的大小
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素
数据框
- 读取本地数据
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #读取文件，分隔符为Tab，有表头
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把这个数据框赋给一个变量a
2.设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
- 数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号）
- 变量的保存与重新加载
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一个变量
load("frame1.RData")#再次使用RData时的加载命令
- 提取元素
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列
X[y] #第y列
X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列（Tab自动补全哦，不过只能提取一列）
直接使用数据框中的变量
提取某两列作散点图：
- attach
将数据框名添加到搜索环境中：attach（c）,作图时就只需输入列名
attach(c)
plot(case,values)
做完后将a删除出搜索环境 detach（c）
局限性：两个以上数据框的列名有冲突时，同时attach会报错。
- with
with(c,{ plot(case,values)
x<<-summary(values) #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，y也就是出了with循环仍有效。})
x #运行完后打印x
