据传说达摩祖师生前被人下毒六次，活了150岁才故去，但当后人打开他的棺材后，却发现里面空空如也，根本就没有祖师的遗骸。
说起达摩祖师之死，有一番颇有意思的故事。传说祖师到了中国后，当时的北魏有一个叫做菩提流支的僧人，十分妒忌达摩祖师。于是就起来歹意，他做了一些素斋来供养祖师，但是在里面下了剧毒，这种毒可以毒死一切生物。
达摩祖师看到这些素斋后，点头一笑，然后当着菩提流支的面吃了下去。菩提流支心中窃喜，以为这样一来，达摩祖师就会被毒死。但达摩祖师吃完后，让人拿来一个盘子，然后将腹中食物吐了出来，没想到那些食物变成了一条条毒蛇，吓得菩提流支赶紧叩头称罪。
达摩祖师并没有怪罪他，让他回去好好反省。过了一段时间，菩提流支又起来歹心，他找来一种更毒的毒药，然后加倍了量，来毒害达摩祖师。达摩祖师依旧吃了下去，然后坐在一块大石头上，将腹中食物屙了出来，这些屙出来的食物竟然将石头毒的爆炸了。
菩提流支依旧不死心，就这样，三次、四次、五次、六次，一共换了好几种毒药，一次比一次毒。
吃了第六次毒药后，达摩祖师笑着对菩提流支说：“我来到中国，是因为这里有大乘根性的众生，因此我把大乘佛法带来，现在已经传法后世，我也就可以离去了。”
然后达摩祖师将自己的法衣和钵盂交给了弟子神光，而后圆寂。弟子们将他埋葬后，认为祖师已经圆寂，众人所能做的就是将他的佛法发扬光大。
就在同时，一个叫做宋云的魏朝大臣在终南山一带碰到了达摩祖师，只见达摩祖师拿着一只鞋站在路边，看样子是在等自己。宋云施礼后，达摩祖师告诉他“你的国王今天死了，你赶紧回去，你的国家会有事情发生。”
宋云问达摩祖师这是要去哪里，达摩祖师告诉他自己要回印度。
宋云回到北魏之后，果然因为国王之死，宫廷之中发生了政变，他带人迅速将政变压下去，并且辅佐新君登基。人们问他怎么知道的消息，他说自己在终南山附近遇到了达摩祖师，是祖师告诉自己的。
人们不信，都说达摩祖师已经死了，不可能会碰到他。但宋云坚持自己见到祖师，大家觉得蹊跷。于是乎，众大臣说服达摩祖师的弟子将坟墓打开，当棺椁打开后，里面除了一只鞋，其它什么也没有。
传说达摩祖师到中国之时，人们问他的年纪，他说自己150岁了，但等他圆寂前，他又说自己150岁了。来时150，死时150，到底他多大岁数呢，他又去了哪里？没有人知道。
