1.下载BWA
wget http://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/bwa-0.7.17.tar.bz2
2. 解压缩
tar -jxvf bwa-0.7.17.tar.bz2
-j:有bz2属性的
-x:解压;
-v:显示所有过程
3. 编译BWA
cd bwa-0.7.17/
make
4. 添加到环境变量
vim ~/.bashrc #打开系统变量配制文件
在bashrc文件末尾追加export PATH=$PATH:/bwapath/bwa-0.7.17' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc #执行命令
5.查看是否安装成功,安装成功的标志是直接运行bwa会出现版本以及用法信息
bwa