scTCR测序中的INKT细胞和MAIT细胞

HLA-like 分子限制性iNKT和MAIT细胞

大多数T细胞识别人类白细胞抗原(HLA,也被称为主要组织相容性复合体,MHC)槽中呈现的肽表位。同源的I类hla样蛋白的一个子集也可以呈现非肽或肽杂交抗原。CD1家族就是一个例子,它由CD1a-CD1e(小鼠中的CD1d1和CD1d2)组成。CD1与类似HLA I类分子的b2 -微球蛋白相关,它的靶向是类似HLA II类分子的囊泡。CD1家族成员具有疏水通道,能够与碳氢烷基链结合。通过将这些烷基链向内锚定,CD1分子将碳水化合物和脂类的亲水性基团暴露给免疫细胞。
CD1.png

MAIT细胞最初是在1993年发现的,它是CD4-CD8- TCRT细胞的一个子集,表达具有不变的TCRαV基因库的CD8αα同型二聚体。麦特细胞通常包含血液中5-10%的T细胞,可表达CD4或CD8,并可包含脾脏、肠道、肺、皮肤和其他器官中10-50%的T细胞。MAIT细胞的配体直到2012年才被发现。第二种HLA -I类分子,mhc相关蛋白1 (MR1),也能够向T细胞显示非经典配体,如由许多微生物产生的叶酸衍生物和B族维生素代谢物。虽然最初的工作将MR1描述为MAIT细胞的强效激活剂,但研究人员试图将MAIT TCR和MR1共结晶,从而识别出MR1所呈现的微生物代谢物。MR1只能在含有B族维生素的培养基中成功折叠,而这种结合并稳定MR1的6-甲酰翼蛋白分子不能激活MAIT细胞。相反,鼠伤寒链球菌和其他细菌的培养既稳定了MR1,又激活了MAIT细胞。最近的努力导致了MR1四聚体的成功开发,可以明确识别抗原特异性MAIT群体。

识别MAIT和iNKT细胞

MAIT和iNKT细胞.png

注:在人类中,MAIT细胞的频率比iNKT细胞要低(MAIT细胞在外周血和某些组织中的频率可以比iNKT细胞高100多倍),而在实验室小鼠株中则相反。由于小鼠体内有大量的iNKT细胞,以及MAIT细胞分析试剂的早期发展,与MAIT细胞相比,iNKT细胞在小鼠体内的研究更为广泛。

https://support.10xgenomics.com/single-cell-vdj/software/pipelines/latest/algorithms/inkt-mait
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