载体元件：
复制起始位点(ori)：DNA复制起点，带动目的基因在内的复制单位的复制，克隆载体必备元件
启动子(promoter)：转录时RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列，本身不被转录，与RNA
聚合酶结合后，启动下游基因的转录，表达载体必备元件
起始密码子(ATG)：翻译起始位置
SD序列:原核基因中mRNA起始部位ATG上游富含嘌呤的碱基序列，为mRNA与核糖体的结合位点称SD序列
kozak序列：真核生物ATG上游的一段序列，通常是GCCACCAUGG，核糖体能够识别mRNA上的这段序列并把它作为翻译起始位点，在翻译的起始中有重要作用。
RNA聚合酶(RNApolymerase)：是以一条DNA链或RNA为模板，三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA的酶。因为在细胞内与基因DNA的遗传信息转录为RNA有关，所以也称转录酶，真核生物的RNA聚合酶分三类(根据其对抑制物a-鹅膏蕈碱的敏感性不同)
启动子：是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列，它含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，多数位于结构基因转录起始点的上游，启动子本身不被转录。根据聚合酶依赖，启动子又可分为RNA聚合酶l(pol)、RNA聚合酶ll(poll) 、RNA聚合酶III(poll)依赖型启动子。
真核常用启动子
过表达载体：
启动子+CDS序列（MCS位点）+tag+筛选标记（荧光、抗性）
抗性基因
Blasticidin S，杀稻瘟菌素S（灭瘟素）
在研究中，Blasticidin S用于筛选携带有bsr或BSD耐受基因的转染细胞。杀稻瘟菌素具有快速而强效的作用模式，很低的抗生素浓度便能导致细胞迅速死亡。
G418 Sulfate(Geneticin) 遗传霉素：
G418 Sulfate（G418硫酸盐），也称作Geneticin（遗传霉素），是一种结构类似于庆大霉素B1（Gentamycin B1）的氨基糖苷类抗生素，通过影响80S核糖体功能和阻断延伸步骤来干扰蛋白合成，对原核和真核等细胞都有毒性，包括细菌、酵母、高等植物和哺乳动物细胞 ，也包括原生动物和蠕虫。其抗性基因（主要为neo基因）位于转座子Tn601（903）或Tn5（来源于细菌），但是可以在真核细胞中表达。通过基因重组技术将这些抗性基因导入细胞，使其获得对G418的耐药性，从而用来筛选和维持培养携带抗性基因的原核或者真核细胞。
蛋白表达特殊序列
蛋白定位相关序列：用于蛋白定位的序列，多为几个到几十个氨基酸的短肽核定位序列(NLS):能与入核载体相互作用，使蛋白能被运进细胞核。病毒SV40的T抗原的NLS序列为:PPKKKRKV
内质网定位序列：内质网驻留序列多为KDEL，4个肽信号序列；
信号肽：引导新合成的蛋白向细胞外分泌的短肽，一般分泌型蛋白均有信号肽；
Tag标签：一般位于目的蛋白C短或N端，用于后期目的蛋白的纯化、检测等；
His：常用6个连续的组氨酸残基(His6)构成的小肽，一般6-10残基都可以使用，分子量小；
Flag：Flag标签为编码8个氨基酸的亲水性多肽(DYKDDDDK)，易于用Anti-Flag的抗体进行检测；
HA：HA标签蛋白，序列为YPYDVPDYA的9个氨基酸残基多肽，易于用Anti-HA的抗体进行检测。
基因链接序列——2A肽、IRES
一个启动子启动两个独立基因表达正常情况下，一个启动子可以启动一个独立基因的表达(野生型或融合型)，当需要一个启动子启动两个独立基因表达时，可以使用2A肽(T2A、P2A等)或IRES连接:
T2A连接两个基因时，两个基因连接成为一个 ORF(开放阅读框)，转录为一条mRNA， 翻译成一个融合蛋白(由自裂解肽T2A连接)，这个融合蛋白会被识别T2A的蛋白酶切成两个蛋白。所以这两个蛋白的摩尔比理论上是 1：1。
缺点：T2A是一个大约23个氨基酸的多肽。切割后前后蛋白会带有T2A残基
IRES(核糖体进入位点)：IRES作为额外的核糖体募集位点起作用，允许翻译起始发生在除了翻译起始位点之外的mRNA内部区域。连接两个基因时，两个基因连接成为一个 ORF(开放阅读框)，转录为一条 mRNA，但是翻译的时候由于IRES位点引入核糖体，两个基因分别有自己的起始密码子和终止密码子，由两个核糖体主导，同时翻译成为两个独立的、 无修饰的蛋白。
缺点：IRES的存在有时候会影响mRNA的结构，IRES后面的基因翻译蛋白的水平有可能与IRES前面的基因蛋白水平不一致。
转录终止Poly A尾
作用:
1.可以帮助延长转录本的寿命，免受核算外切酶的降解。
2.RNA聚合酶lI启动mRNA转录，转录终止和加poly(A)协同进行。
常用的转录终止子有SV40hGHBGH,有AAUAAA基序促进聚腺苷酸化和转录终止。另外，哺乳动物细胞的poly(A)信号和病毒包装系统的联合使用可能会降低病毒滴度，因此，病毒载体通常会使用WPRE或者其他的弱poly(A)信号，作为转录本稳定元件和出核元件。
