数据科学 IPython 笔记本 8.5 简单的散点图

8.5 简单的散点图

原文:Simple Scatter Plots

译者:飞龙

协议:CC BY-NC-SA 4.0

本节是《Python 数据科学手册》(Python Data Science Handbook)的摘录。

另一种常用的绘图类型是简单的散点图,是折线图的近亲。这里的点并不由线连接,而是单独表示的点,圆或其他形状。我们首先为绘图配置笔记本,并导入我们将使用的函数:

%matplotlib inline
import matplotlib.pyplot as plt
plt.style.use('seaborn-whitegrid')
import numpy as np

散点图和plt.plot

在上一节中,我们查看了生成折线图的plt.plot /ax.plot。事实证明,同样的函数也可以生成散点图:

x = np.linspace(0, 10, 30)
y = np.sin(x)

plt.plot(x, y, 'o', color='black');
png

函数调用中的第三个参数是一个字符,表示用于绘图的符号类型。正如你可以指定选项,例如'-''--'`来控制线条样式,标记样式有自己的一组短字符串代码。完整的可用符号列表,可以在plt.plot``的文档中找到,或者在Matplotlib 的在线文档中看到。大多数选项非常直观,我们将在这里展示一些更常见的:

rng = np.random.RandomState(0)
for marker in ['o', '.', ',', 'x', '+', 'v', '^', '<', '>', 's', 'd']:
    plt.plot(rng.rand(5), rng.rand(5), marker,
             label="marker='{0}'".format(marker))
plt.legend(numpoints=1)
plt.xlim(0, 1.8);
png

为了获得更多选项,这些字符代码可以与线条和颜色代码一起使用,来绘制点以及连接它们的线:

plt.plot(x, y, '-ok');
png

plt.plot的附加关键字参数,指定了线条和标记的各种属性:

plt.plot(x, y, '-p', color='gray',
         markersize=15, linewidth=4,
         markerfacecolor='white',
         markeredgecolor='gray',
         markeredgewidth=2)
plt.ylim(-1.2, 1.2);
png

plt.plot函数的这种灵活性支持各种可能的可视化选项。可用选项的完整说明,请参阅plt.plot文档。

散点图和plt.scatter

第二种更强大的创建散点图的方法是plt.scatter函数,它的用法与plt.plot函数非常相似:

plt.scatter(x, y, marker='o');
png

plt.scatterplt.plot的主要区别是,它可用于创建散点图,其中每个单独的点的属性(大小,填充颜色,边缘颜色等)可以单独控制,或映射到数据。

让我们通过创建一个随机散点图,包含多种颜色和大小的点,来展示它。为了更好地查看重叠结果,我们还将使用alpha关键字来调整透明度:

rng = np.random.RandomState(0)
x = rng.randn(100)
y = rng.randn(100)
colors = rng.rand(100)
sizes = 1000 * rng.rand(100)

plt.scatter(x, y, c=colors, s=sizes, alpha=0.3,
            cmap='viridis')
plt.colorbar();  # show color scale
png

请注意,颜色参数自动映射到颜色标度(此处由colorbar()命令显示),size参数以像素为单位。通过这种方式,点的颜色和大小可用于在可视化中传达信息,以便可视化多维数据。

例如,我们可能会使用来自 Scikit-Learn 的 Iris 数据,其中每个样本是三种类型的花朵中的一种,其花瓣和萼片的大小是仔细测量的:

from sklearn.datasets import load_iris
iris = load_iris()
features = iris.data.T

plt.scatter(features[0], features[1], alpha=0.2,
            s=100*features[3], c=iris.target, cmap='viridis')
plt.xlabel(iris.feature_names[0])
plt.ylabel(iris.feature_names[1]);
png

我们可以看到,这个散点图使我们能够同时探索数据的四个不同维度:每个点的(x, y)位置对应于萼片的长度和宽度,该点的大小与花瓣宽度有关,并且颜色与花的特定种类有关。像这样的多颜色和多特征散点图,对于数据探索和展示都是有用的。

plot VS scatter:效率的注解

除了plt.plotplt.scatter中提供的不同功能之外,为什么你选择使用一个而不是另一个? 虽然对于少量数据而言并不重要,因为数据集大于几千个点,plt.plot可能比plt.scatter明显更高效。原因是plt.scatter能够为每个点渲染不同的大小和/或颜色,因此渲染器必须执行单独构建每个点的额外工作。

另一方面,在plt.plot中,点基本上总是彼此的克隆,因此确定点的外观的工作,仅对整个数据集执行一次。对于大型数据集,这两者之间的差异可能会使性能大不相同,因此,对于大型数据集,plt.plot应优于plt.scatter

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