送给lxh小姐姐
每日任务
一、linux的App Store
1.认识miniconda
2.下载miniconda
二、miniconda的安装、配置
1.怎么安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
2.激活
source ~/.bashrc
3.镜像
# 使用清华镜像# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda conda config --set show_channel_urls yes
三、miniconda的使用
1.查看当前所有软件列表
conda list
2.搜索软件
conda search fastqc
3.安装软件
conda install fastqc -y
4.卸载软件
conda remove fastqc -y
#注：-y表示自动安装
四、conda环境
1.查看当前有哪些环境
conda info --envs
#注前面带*是默认
2.创建rnaseq安装fastqc、trimmomatic生信软件
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
3.检查软件环境是否搭建好
conda info --envs
4.激活rna-seq环境
conda activate rna-seq
五、卸载安装上的conda重新再来一遍
rm -r biosoft
- 重新再来一遍孰能生巧
- 报错了主动查找原因
- 不灰心，不放弃
