Linux环境下的软件安装
今天的学习内容是Linux环境下的软件安装。首先需要了解conda,一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,用于安装多个版本的软件包及其依赖关系,并在它们之间轻松切换。简言之,conda相当于Linux环境下的应用商店,用于软件的下载和安装。
minicoda的下载与安装
Miniconda是conda的精简版安装程序。 它是Anaconda的小型引导程序版本,仅包含conda,python,它们依赖的软件包以及少量其他有用的软件包,包括pip,zlib和其他一些软件包。 使用conda install command
可以从Anaconda存储库中安装720+个其他conda软件包。
minicoda的下载
在官网找到相应的下载链接,复制该链接,使用wget命令下载
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
minicoda的安装
使用 bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh 命令进行安装,安装过程中根据提示输入enter或yes。
bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
minicoda的激活
source ~/.bashrc
添加清华源镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda安装软件
conda list [-n env_name] # 查看当前环境(指定环境)下安装的包;
conda search pkg_name # 查看安装包;
conda install pkg_name #安装包
conda update pkg_name # 更新指定的安装包;
conda remove pkg_name # 卸载指定的安装包
使用conda创建环境
conda info --envs # 查看当前现有的conda环境;
conda deactivate # 退出当前的conda环境;
conda create -n env_name [python=<version>] # 创建环境,并指定python版本,或者安装包等;
conda remove -n env_name --all # 删除指定环境
今天跟着课程指引顺利完成了minicoda的安装,并学会用conda安装软件等操作。同时也在conda官网查看有关conda的相关内容,进一步加深对conda使用的了解。
虽然每天学习的新内容不多,但都是一砖一瓦的基础知识,好好学习,为以后深入学习与应用奠定坚实基础!明天继续加油哦!