R包安装之非零状态

我们在安装某些R包的时候,可能有下面这些情况


had non-zero exit status

导致这个状态的原因有:

1.包加载安装过程中编译不能通过,因此执行安装加载通过不了。
2.library中路径有中文字符出现
3.library,没有指定安装成功。
4.缺少包的依赖。
5.依赖包冲突:依赖包版本过低或过高,需要remove或delete
6.R的依赖包的镜像不在国内,需要翻墙获取依赖包
7.使用R语言的人对Rstudio和RGUi没有正确安装,导致无法加载到路径中去
8.安装部分R语言包需要以管理员身份运行软件,使得相关依赖包能够写入到library中

一般来说,解决这个问题主要有两种方式:
第一就是看报错信息,缺少哪一个包的依赖,就安装哪一个包即可(也可以手动安装);如果是包之间产生冲突(比方说命名空间冲突),那么就remove掉这个包就可以了

第二个是比较懒的方法,即在安装包的时候,加dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock')

#安装1:
BiocManager::install("package",version = "3.10",dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock'))

#安装2:
install.packages("package", dependencies=TRUE, INSTALL_opts = c('--no-lock'))

即交代清楚依赖关系,并返回无法锁定目录

或者从本地安装:

install.packages("path/package",repos = NULL, type="source")

当然,还有的情况需要换几个repos才能安装成功
这里推荐一个常用的repos

repos='http://cran.rstudio.com/'
install.packages('packages', repos='http://cran.rstudio.com/')

或者使用pak来自动安装依赖包:
安装pka

install.packages("pak")
#或者开发版
install.packages("pak", repos = "https://r-lib.github.io/p/pak/dev/")

安装包:

# CRAN或Bioconductor
pak::pkg_install("package")

# github
pak::pkg_install("github_path")
## 例如 
pak::pkg_install("tomwenseleers/export")

参考:https://zhidao.baidu.com/question/1576529847462184940.html

https://blog.csdn.net/tandelin/article/details/87719623

https://stackoverflow.com/questions/14382209/r-install-packages-returns-failed-to-create-lock-directory

https://mp.weixin.qq.com/s/iAO1emE-DJ07V8GeNFmr4Q

https://www.jianshu.com/p/6136794d65ab?utm_campaign=haruki&utm_content=note&utm_medium=reader_share&utm_source=qq

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 205,132评论 6 478
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 87,802评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 151,566评论 0 338
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,858评论 1 277
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,867评论 5 368
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,695评论 1 282
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 38,064评论 3 399
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,705评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 42,915评论 1 300
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,677评论 2 323
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,796评论 1 333
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,432评论 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 39,041评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,992评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,223评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 45,185评论 2 352
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,535评论 2 343