AmyTree算法

1. input要求：四个文件，Y－SNP基因型，树文件，编译名称文件，参考序列

2. Call Quality test：高质量则用ref＋变异一起做分析，低质量则用变异做分析

3. Y－SNP来判断个个节点的状态：高质量时，match 85%为true，低质量时，match 5%为true

4.V算法： return所有叶子节点是True的情况

5. h算法：return节点，这些节点没有自节点为True，或已经到了叶节点

6.c算法：只有叶子节点的祖先节点在h算法中被return了，才保留

7.s算法：如果C算法中还有多个，则报告最深度的叶节点

最后编辑于：2017.11.27 05:47:02

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