身为分子生物学实验的小白,今天分享一下做PCR的“乐趣”!!!
不知道你有没有发现,咦?我的PCR为什么没有扩增出条带?反正我是遇到过,前前后后浪费了将近约2h的时间,结果却是:Nothing!只有Maker条带。很是苦闷呐!于是我查资料,问师兄师姐,谢天谢地,终于有了结果。
现在把一下经验分享给大家:
1.引物设计:引物设计一定要具有特异性,网上也介绍了许多引物设计软件,不过我觉得傻瓜软件——snapgene就挺好用的,设计起来也非常方便,还可以自行模拟PCR结果,看引物设计的是否合理
2.模板浓度:这个的话,根据实验室所用的聚合酶说明书就可以了,对于质粒的话,10ng以内就可以的
3.水的选择:一定要是灭过菌的去离子水或双蒸水,不要用蒸馏水哟
4.泡泡:PCR反应最好别有气泡,有的话,可以用手轻弹,短暂离心一下
3与4都是一些小细节,但是忽略了就有可能做不来实验了,曾经我就犯过这样的错误,导致最简单的16s序列都没有P出来。
5.退火温度:一般55℃就可以的,我的建议是,当你确定前四条都没有问题的时候,再去考虑退火温度的问题,可以选择降落PCR来确定最佳的退火温度
6.酶的选择:对于选择哪个聚合酶,我还是相信品牌的,推荐PrimeSTAR系列(实验室师兄推荐的,我也用过,觉得效果不错),附网站链接:
https://www.takarabiomed.com.cn/ProductShow.aspx?m=20141215102916640154&productID=20141226142531140921
好了,关于PCR反应的感悟目前就是这些,以后再分享其他的有关分子实验的内容......