写在前面
Emmm,转录组筛了十来个基因,想着扩大材料看看表达模式是否与数据体现相符,于是需要设计一下qPCR引物。当然,自然是有一些软件可以使用,但用起来不太方便。至少问了一圈,大伙可能都还不太知道相关实现。索性,自己写一个。操作简单,打包一下 Primer3 就可以了。于是得到今天的插件「Batch qPCR Primer Design」。
批量设计引物
注意到,这个功能以插件形式存在,后续直接在「TBtools」插件商店下载即可。打开功能,界面如下,
使用示例如下
稍等一会即可,设计完了会自动提示。
每两行是一对引物,于是,只要复制黏贴到「引物合成单」,发送给公司即可...
PS:逻辑上,支持无限个序列输入。请注意,这个功能仅用于设计 qPCR 引物。对于引物特异性检测,可以用 「Primer Check」插件,想想就简单。你可以整理整理表格,或者是直接用 「Fasta to Table」转换后无缝对接两个功能。
写在最后
插件是 Windows 和 MacOS 通用,回头释放,使用简单。不做赘述。当然,还是要注意,更新到最新版本的「TBtools」。