导师交给我一个基因,该怎么去查询这个基因的保守结构域,以便我后续对这个基因的进一步研究呢?话不多说直接上图:
1. NCBI中CDD数据库的查询和使用
打开NCBI首页,选择红圈里的选项
2. 进入CDD数据库,还是红圈里的选项
3. 进入后有以下界面,如果是单条序列,直接进入CD-Search选项,如果要批量查询,则进入Batch-CD-
Search。此处以单条序列为例进行介绍。
4. 进入CD-search后可直接粘贴核苷酸序列或者氨基酸序列到此框中。
5. 举个栗子:
输入我要查询的序列后就有了下面的结果,这样我就可以继续去查和这个基因有关的文献,以及该结构域的各种信息,为后续研究打下基础。