1.思维导图
DAY7-初涉测序.png
2. 一代测序
sanger法测序（“双脱氧终止反应法”，观看）：顾名思义，DNA在聚合酶的作用下进行无数次合成，每次到了ddNTP就终止，这样就得到不同长度的序列，每个序列的末端就是带有荧光标识的ddNTP，这样每次只测一个ddNTP，就能反推到序列了。
需要以下材料
- DNA模板
- 只有5‘端的带荧光的dNTP 即ddNTP
- 引物（打开反应的钥匙，并起到在特定的点开始聚合）
- DNA聚合酶
- 4种dNTP
3. 二代测序（Illumina公司：边合成边测序）
需要：
DNA文库：把基因组DNA打断，然后再许多的DNA片段两头加上了接头。（接头序列已知，但中间插入的DNA片段序列未知）
flowcell ：8条通道，并做了化学修饰（两种DNA引物种在上面，引物和DNA文库的接头（adapter）序列互补），当DNA液体流过flowcell时，接头和引物配对的序列不会被冲走。
桥式PCR：将文库种到flowcell上，并进行扩增
测序：和一代测序类似，（但是一个循环后，会使用酶将3’端的羟基暴露出来）
index：在adapter里面（还需要进一步体会）
4. 三代测序
PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的纳米孔单分子测序技术为代表 （不懂0.0）
5. 专有名词
基因组学（即核酸的序列分析）
全基因组
全外显子组
简化基因组
转录组（基因表达分析）
mRNA-seq
。。。
蛋白组学
代谢组学
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一周的学习完成，感谢小花花和小豆豆老师！OVER~
