western blot试验中遇到的问题,希望能帮到正在苦恼的你~

写在前面:western blot,这个不做个十次八次,基本出不来好看条带的实验,相信让很多小伙伴都感到头秃。不过只要持之以恒,善于总结,问题不大,随着实验次数的增多,会持续更新内容,个人见解存在一定局限性,欢迎一起交流哈~

比不上高分杂志嘿嘿,但对于只做了六七次的我,算是最高水平了

做胶 

Q. 注意事项

配缓冲液过程中,过硫酸铵最后加,防止出现过多气泡。

温度:温度越高凝固越快,胶通常在0.5-1h内凝固最好。充分凝固后可保鲜膜包裹4℃过夜,第二天使用。

Q. 如何判断样品总蛋白的提取是否成功?

跑胶前:蛋白浓度检测,浓度低可能是提取不成功。

转膜后:丽春红染色,正常的话可以看到很多蛋白条带。

显色后:内参及目的蛋白的检测。

上样

Q. 上样时有的样品沉淀,有的清亮?

1.考虑没有完全变性,适当提高SDS浓度,同时延长煮沸时间。

2.考虑蛋白浓度过高,加入缓冲液稀释。

电泳

Q. 影响电泳结果的因素

1. 电压:低电压下筛选效应充分,条带漂亮。

2. 胶的均匀度:胶越均匀,条带越窄,分离越均匀。

Q. 条带形状

︶笑脸型:凝结冷却不均匀,中间冷却不好。

︵皱眉状:可能凝胶和玻璃板底部有气泡。

拖尾:样品溶解不好

纵向条纹:样品中有不溶性颗粒

条带偏斜:电极不平衡或者加样位置偏斜

条带两边扩散:加样量过多溢出

Q. 大分子量蛋白转移效率低?

转移缓冲液加SDS(终浓度0.1%);提高转移电压/电流;增加转移时间

Q. 小分子量蛋白转移需注意?

使用0.22um 或0.1um 的NC膜;减少转移时间,30min足够。

转膜

我们用的是湿转法,效率比较高,如果目的蛋白很小,可以考虑半干转。

Q. 过转和转膜不充分?

对于大分子量(>100kd)蛋白而言,一般不用考虑过转情况,看条带对应的marker是否转上,即可确定自己的条带是否转上。如果没有,适当增加电压/电流,延长时间,还有避免胶和膜中间有气泡。

小分子量(<15kd)尤蛋白容易出现过转,同样丽春红染膜或观察marker即可确认有没有过转。

Q. PVDF的预处理?

PVDF膜先置于甲醇中处理10 s,然后浸于电转缓冲液中10 min,再夹三明治。NC膜则不需要预处理。

封闭

我们用的是5%脱脂奶粉,10%TBS缓冲液配制。

Q. 封闭时间

正常情况,室温封闭1h即可。如果曝光背景过高,可以适当延长封闭时间至2-5h,也可以4℃过夜,封闭时间过长并不会导致检测信号减弱

如果延长了封闭时间,背景还是高。考虑抗体浓度过高,可稀释使用;目的蛋白丰度太低,信号弱。

Q. 封闭液有杂质颗粒?

(静置牛奶使大颗粒沉淀,仅用上层)

牛奶里面会有一些不悬浮的大颗粒,对封闭无益。可以在转膜开始之后配好牛奶,在充分搅拌好的前提下,静置于4℃。使用时不要担心牛奶不均而特意混匀,只吸上层部分完全ok。

孵抗体

Q. 如何提高磷酸化抗体的检测质量?

提高蛋白上样量;适当增加封闭时间,延长一抗孵育时间;封闭的选择:5%脱脂奶粉? 5%BSA?;磷酸酶抑制剂;样本低温操作,最好是新鲜样品,反复冻融易降解。

显影

Q. 目的条带很弱?

加大上样量,调整抗体比例,转膜效率。

Q. 背景太深?

降低抗体比例;封闭液中加去垢剂:吐温20;降低上样量;用其他蛋白做封闭液:5%BSA,serum;

Q. 条带有时清晰,有时弥散?

样品可能存在降解;转膜不及时造成扩散。


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