DART-seq 则是利用m6A的特异性识别功能域(YTH domain)将胞嘧啶脱氨酶APOBEC1招募至m6A修饰位点附近,依靠APOBEC1的C-U的嘧啶转化,结合RNA-seq技术,通过鉴定C到U的突变也可以实现不依赖于抗体的m6A修饰位点鉴定。
PS.根据这种思路,可以将拟研究的RBP与APOBEC1进行融合,然后基于编辑位点判断RBP潜在的靶标。
Reference
Meyer KD. DART-seq: an antibody-free method for global mA detection. Nature methods, 2019, 16: 1275-1280