生信
1.linux操作系统
(1)应用场景:supercomputer 服务器
(2)权限控制
(3)命令行模式:区别于windows的图形界面,linux的操作靠命令行来实现
(4)目录结构:目录相当于windows的文件夹,linux系统没有C/D/E/F盘,文件系统呈树状。由于用户不唯一,像类似“我的电脑”这种级别的文件,用户是无法访问的,每个用户能到达的最高级目录“宿主目录”,即用户登录时所在的目录,宿主目录放在home目录下。(???)
2.为什么学生信的都要用linux?
(1) 系统开源、免费,不需要图形界面,有效节约资源;命令行模式可以批量、高效地处理文件,满足数据分析的要求。
(2)当你需要跑几十、几百G数据的时候,用windows,电脑立刻就挂了。
3.怎样实现零成本召唤linux?这是一个原生运行在 windows10 上的子系统
(1)设置-更新和安全-针对开发人员-启用开发人员模式
(2)设置-更新和安全-针对开发人员-启用开发人员模式
(3)重启
(4)下载高大上的工具ubuntu。microsoft store里有
(5) 启动ubuntu 和用户设置
窗口显示正在安装-安装成功,设置用户名和密码,相当于注册,这里输入密码是没有任何提示的,一次性打完不要怀疑键盘坏了。
(6)更新:输入 sudo apt update
完成后输入 sudo apt upgrade
sudo 代表管理员,apt相当于install(安装),下载和安装了更新,就可以投入使用啦
(7)注意:这个linux界面仅能用于学习linux基本操作,想要实战处理数据跑程序的话你的电脑配置不够,需要用到服务器。如果你所在单位有服务器,可以直接申请账号。如果没有可以去阿里云官网看看。远程登录服务器需要下载一个免安装软件putty,需要ip地址和用户名就可以登录了。
云服务器上的linux
1.登录:ssh 用户名@ip地址,例如ssh bio03@120.110.xxx
软件下载:百度网盘:https://pan.baidu.com/s/1upnRTXwkI0hvxuuA2Gm49w 提取码: cnrv
2.linus高频操纵命令
(1) pwd
: print working directory 显示当前路径
/home/doudou
就是我的当前路径[图片上传失败...(image-f0db7-1614134616280)]
(2) mkdir :make directory-- 创建你的空目录
后面是注释,就是解释代码的文字。
mkdir biosoft #存放生信软件 mkdir project #存放生信项目 mkdir tmp #存放一些杂七杂八 mkdir src #存放源代码
(3)ls
显示列表,不管是目录还是文件,都能显示[图片上传失败...(image-a57e55-1614134616280)]
(4)删除:删除的操作对象分为三类:普通文件、空目录、有内容的目录。他们的对应的命令是略有不同的。
1)删除文件--rm
2)删除空目录--rmdir
3)删除非空目录--rm -r
4)注意:
1.这三个命令后面都要跟上你要删除的目录名。
2.rm-rf
-r 递归,多级目录一并删除
-f 强制删除,不用任何提示
所以如果rm -rf后面不加目录名,就死定了,删除你服务器的所有东西。
(5) cd
1)cd
接一个目录名,表示进入该目录
2) cd -
返回刚才的目录
3)主目录(家目录):直接cd
,效果与cd ~ 一致
(6)vi
新建脚本或者文本文档(vi是linux中的文本编辑器)
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vi hello_world.txt
先保证电脑切换到了英文输入法,然后敲i键,就可以输入了
写下你的感悟~几行简短的英文
按Esc键 #退出编辑模式
:x #在左下角输入,意思是保存并退出</pre>