燕青自与众兄弟分别后，一门钻研武学，尤其内功心法。神医安道全曾经送给燕青一套内景图，得入云龙公孙胜指点，创出九阳五行春秋功，练习三十年，大小周天可以全部打开，全身穴位随心起闭，既使遇到后世的吸星大法也无法将功力吸出一点，而且有什么毒，可以用功力从经脉导出，以汗液的方式排解。但是这种功夫不讲究吸收别人的功力，燕青觉得那是邪门武功所以在练习时尤其注意了这一点，如果小周天通了之后，在心法上改动一点，就是吸星大法，如今燕青已经练到第六重，小周天打开了，可以修成吸星大法，也可以继续前面三重，最后练成九阳五行春秋功。
在轻功方面，他结合鼓上蚤时迁和神行太保戴忠的长处，将两人的功夫合二为一，创出幻影无形仙羽神迹功，这种功夫，一是轻，踏雪无痕，遇水可漂;二是快，牛皋箭法应该说很好，百步穿杨，基本和小李广花荣一个水平，有一次牛皋和燕青切搓武功，牛皋和燕青一马同胯，牛皋弯弓搭箭射百米之外的一个酒壶，箭发出去，影子一闪，酒壶在牛皋怀里，滴酒未洒，箭在马笼头上别着呢，燕青还在他后面的马背上，怎么回事，牛皋不知道。
当年，燕青摔跤的功夫了得，拳法和武器上一般，因此在修习内功和轻功的同时，燕青着重比较了南北拳法，创出一套八卦游宫拳，后来这套拳法流传到丐帮发展为降龙十八掌;研究十八般兵器之后，燕青选则了宝剑，创出一套一百单八式的轻风落叶化雪剑法，据说燕青使用这套剑法在大雪纷飞的院子里舞动，半个时辰内身上没有一片雪花。
