数据分析入门——手把手带你准备一个好用的Jupyter环境

Jupyter作为数据分析必备神器,本篇文章来教你如何搭建一个小团队使用的Jupyter环境。

基础环境——Docker

简要说一下Docker的好处,就是部署极其简单,因为常规的环境、开源项目都有现成的docker镜像,一行命令的就能完成部署。

如何部署Docker请看官方文档️。

针对不同环境有不同的安装方法

服务器通常都是Linux的,所以给大家提供一下linux的快速通道️

Web UI

单机解决方案—— Portainer

Docker 社区版是没有图形界面的,不方便管理,所以单机版推荐大家使用[Portainer️]](https://www.portainer.io),安装也非常简单,装好了Docker 以后只需要下面一行命令即可搞定:

$ docker volume create portainer_data
$ docker run -d -p 8000:8000 -p 9000:9000 --name=portainer --restart=always -v /var/run/docker.sock:/var/run/docker.sock -v portainer_data:/data portainer/portainer

集群解决方案——Rancher

集群搭建还是个相对复杂的事情,Docker官方提供swarm的集群方式,一个小的实验环境用倒是没问题,Portainer也支持swarm,但是因为Google的Kubernetes的普及,swarm其实不推荐使用了,因为swarm部署使用的是docker-compose.yml的编排语言,而Kubernetes有它自己的编排语言,而且主流的生产环境应该都是Kubernetes基础的,所以条件允许还是建议选择Kubernetes。


image.png

基于Kubernetes的web UI也有很多,我比较推荐Rancher️,我从1.X开始使用的,是我用过最好用的,没有之一。我们自己的环境全部是Rancher。顺便说一下,Rancher还有一个针对物联网应用场景的k3s,同样也适合硬件资源比较紧张的同学。

Jupyter 的Docker镜像选择

在Docker Hub 上面Jupyter官方提供了18个镜像:



我们主要做数据分析,说高大上点叫数据科学研究的,可以使用这个镜像,也是下载量最大的一个:



如果你是单机环境,可以直接用下面这个命令安装并启动Jupyter的镜像:
docker run -p 8888:8888 jupyter/scipy-notebook

当然,还有各种的环境变量,存储持久化等设置,如:

docker run --rm -p 10000:8888 -e JUPYTER_ENABLE_LAB=yes -v "$PWD":/home/jovyan/work jupyter/datascience-notebook

更多详情请自行阅读官方文档️

下载过程中,你一定会遇到一个很抓狂的事情,就是速度特别慢,那是因为你享受了我们中国特色社会主义国家的优越性,所以,你需要一些额外的骚操作进行加速,具体怎么加速这里就不说了,推荐一篇别人整理好的文章,自己去里面找吧:加速一切,配置国内镜像 - apt/brew/Docker/Python Conda/Maven,提醒一下,里面有conda的加速方法,镜像装好以后记得做一下conda的加速镜像配置,不然你装很多依赖库的时候一样会抓狂。

做完了这些,你就拥有了一个可以远程访问的Jupyter环境,如果你没有额外配置用户认证方面的东西,你直接访问端口是进不去的,你通常会得到以下画面:



每次Jupyter启动的时候都会生成一个token,这个token在启动日志里面可以看到:


最后两行就是

如果一切顺利,你就会看到下面这个界面:

其实,这个环境不仅支持python,还支持Julia和R另外两种适合做数据分析的语言,注意,这里的R和RStudio不是一回事,如果以R分析为主的话还是建议用RStudio Server。
好了,现在你就可以开始愉快的进行数据分析研究了(如果你懂那三种语言的话)。


另外,Jupyter还有一个小福利,就在刚才New下面有个Terminal,它可以帮你创建一个基于浏览器的命令行,这个对于远程使用的用户非常方便,尤其是你的Jupyter还是运行在Docker里面的,这样你不需要一层层的做ssh登陆了,一站式的解决所有问题。

本地工具与Jupyter集成

更多时候,我们希望在本地的IDE中使用Jupyter Server,通常是以下三种原因:

  • 需要结合本地IDE环境提供更多其他方面的开发体验,如更智能的代码辅助、数据库连接工具等等。
  • 需要借助服务器强大的性能。
  • 参与计算的数据源可能有访问限制,本地无法直接访问到。这里可以参考我的另一篇文章:基于Docker和Jupyter,打造一个堡垒机远程管理工具

python开发者用Pycharm的比较多,所以这里简单说一下pycharm的配置:



pycharm中只要我们创建一个ipynb的文件,IDE就会自动识别成为Jupyter Notebook的编辑模式,这里默认pycharm是会给你提供一个Jupyter的本地server的,点开后我们可以配置为我们刚才在服务器上创建的Jupyter Server:



选择Configured Server,然后把日志里面带token的url贴到这里面来点OK,就连接到了远程的Jupyter上面去了,这个时候你可以更加愉快的进行数据分析了。

提示:因为你的本地IDE连接的是远程的Jupyter环境,所以你自己封装的python库、第三方的各种库、外部文件等等,都要确保在服务器环境有,而且路径都是服务器环境的路径,千万不要跟本地混淆了。

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