1589年，纳瓦拉国王亨利四世继承了法国国王，开创了法国波旁王朝。
亨利四世的外公恩里克二世迎娶了法国国王弗朗索瓦一世的姐姐玛格丽特，生下女儿珍妮，后来珍妮嫁给了法国贵族旺多姆公爵安托万·德·波旁（与法王亨利二世的远祖同为法国卡佩王朝国王路易九世），所以不管是父系还是母系，亨利四世都与法国瓦卢瓦王室存在着姻亲关系，他与弗朗索瓦二世、查理九世、亨利三世为三世表亲，成为后继无子的亨利三世的最有力的继承人。
亨利四世自青年时代起就卷入了法国残酷的宗教战争。作为胡格诺派的领袖他逐渐拥有了很高的声望。但是圣巴托洛缪惨案之后，他被软禁在法国宫廷里，接受法王查理九世的庇护。
1584年，由于王储阿朗松公爵弗朗索瓦的死，他成为了法国王位的合法继承人。
1589年亨利三世遇刺身亡后，他继位为法国国王。
考虑到法国还是一个以天主教徒为多数的国度，1593年，亨利四世宣布改宗天主教，5年后颁布了“南特敕令”，宣布天主教为国教，同时给予新教徒充分的信仰自由，体现了在那个时代很难得的宗教宽容精神，结束了30多年的胡格诺战争，充分收获了民心。
亨利四世以他的名言“要使每个法国农民的锅里都有一只鸡”而流芳后世，他也确实在经济恢复上取得不错的政绩。他任用贤良，整顿财政，成效显著。法国的经济在他统治时代发展起来。亨利四世成为一个深受人民的爱戴的君主。
亨利四世成为法国国王之后，他和玛戈的婚姻因为没有子嗣更显苍白。“他们都是多情之人，但钟情对象不是对方”，他们的关系从平淡夫妻转为朋友，后来两人友好的离婚，亨利四世娶了来自佛罗伦萨王族的玛丽·德·美第奇，后者为他生了一个孩子，路易十三。
1610年年5月13日，亨利四世于巴黎遇刺，第二天身亡。凶手是一名狂热的天主教徒，名为弗朗索瓦·拉瓦莱克，他反对国王挑起对西班牙的战争，因为西班牙身为天主教的领头势力，在天主教世界拥有崇高的威望，这名教徒为了阻止法兰西王国与西班牙帝国的战争，毅然刺杀了曾为“异端”的亨利四世。
亨利四世死后，长子路易十三继承王位，当时他年纪尚幼。人近中年的玛丽王后带着王子在圣丹尼教堂加冕。在玛丽和红衣主教黎塞留的斗争中，法国开始了称霸欧洲的步伐。
路易上台后，承袭了其父亨利四世"天然疆界"的政策，想要将法国置于高卢的位置上，在原属古代高卢的一切地方建立新的高卢，将疆界推进至莱茵河、萨伏伊、阿尔卑斯山脉东麓，占领佛兰德斯地区，把瑞士联邦、伦巴第、皮埃蒙特、威斯特伐利亚地区收为附庸。当时欧洲，西班牙虽然已经衰落，但实力仍然较强，通过和同样处于哈布斯堡家族统治下的奥地利的同盟，依旧维持着对法国的遏制政策。西班牙依然维持着对尼德兰南部的统治，直接威胁着法国北部边境，并试图再次吞并已经独立的荷兰。英国虽然有所发展，但实力总体偏弱，且国内宗教矛盾尖锐。亨利四世提出天然疆界的政策，其实质就是要扩张法国领土，打击西班牙，称霸欧洲。
但是，太后的家族意大利的顶级豪门美第奇家族却与西班牙关系密切，所以太后实行了亲西班牙政策，并主导了路易十三和西班牙公主安娜的婚姻，还将路易十三的妹妹伊莎贝尔嫁给了安娜的哥哥菲利浦四世。
路易十三不满意太后的亲西政策，试图改变太后的想法，但却一直受到太后的压制。
1617年，路易十三派人暗杀了太后的宠臣，太后逃奔到布鲁尔。虽然后来经人调解太后回到了巴黎，但母子的隔阂依旧。宫中形成了以路易十三为核心的王党和以太后、国王的弟弟奥尔良公爵加斯东为核心的后党。
在这次调解中，黎塞留崭露头角，得到路易十三的赏识，后来被任命为枢机主教。黎塞留在内政方面推行君主专制。
1618年，欧洲爆发三十年战争，起因是捷克为反对奥地利的宗教压迫政策揭竿而起，并将王位许给了英王詹姆斯一世的女婿，但在西班牙的帮助下，奥地利镇压了捷克起义。
之后，奥地利和西班牙趁机扩张各自的势力，企图镇压欧洲的新教运动，德意志北部新教诸侯和荷兰等国陷入了恐慌。法国在这次战争中一开始并未出兵，而是以金钱支持丹麦、瑞典进攻神圣罗马帝国，打击奥地利的势力。
当丹麦，特别是瑞典在德国高奏凯歌时，法国又在外交上孤立他们，以维持中欧的平衡。但当奥地利任命了华伦斯坦为帝国军队的统帅后，瑞典战败，局势似乎又朝着对奥地利有利的方面发展时，法国宣布出兵。最终趁着双方筋疲力尽时，法国在军事和外交上的手腕获得了一系列的胜利，终于在1648年赢得了这场战争的胜利，将阿尔萨斯等地划入了自己的版图，大大扩张了自己的势力，此时离路易十三去世已经五年了。
路易十三一直对母亲、弟弟和出身哈布斯堡家族的妻子怀有戒心。玛丽·德·美第奇也阴谋废黜路易十三，立奥尔良公爵为国王。而国王夫妇不和，婚后多年无子，也给太后和奥尔良公爵的阴谋提供了便利。在黎塞留的铁腕政策的打击下，奥尔良公爵最终失势，太后也逃到了比利时首都布鲁塞尔，处于西班牙人的庇护之下。
1638年，安娜王后生下王储（未来的路易十四），王室终于稳固了。两年后，奥尔良公爵菲利普也出生了。而原奥尔良公爵加斯东只有一个女儿，失去了对抗国王的最后资本。
在法国历史上，路易十三曾经被人视为昏君的代表。他的父亲是赫赫有名的亨利四世，法国历史上仅有的三个“大帝”之一。他的儿子更是赫赫有名的太阳王路易十四，统治着极盛时期的法兰西帝国。夹着无比荣耀的父亲和儿子中间，路易十三显得那样的暗淡无光。
确实，路易十三是个没什么才华、也没什么天分的国王，他唯一的爱好是打猎，生活中的他软弱、慵懒，他的性格内敛、阴郁，不讨人喜欢。他的一生写满了悲剧，用天煞孤星形容毫不为过：十岁时父亲就被刺杀；十几岁开始就因为政治原因与母亲对立了一辈子，他的母亲到死也没原谅自己的这个儿子；跟自己的妻子冷战数十年；自己唯一的废材亲弟弟一辈子都在造自己的反；与王后的侍女奥福特、拉法耶特先后萌发的两段纯洁精神恋爱，都因潜在的政治因素遭到首相黎塞留强行终止；晚年深爱的男宠桑·马尔斯竟然联合各方势力密谋推翻自己与黎塞留、推弟弟加斯东亲王为法国国王，阴谋曝光后马尔斯被黎塞留以叛国罪当众斩首。
但是这样一个人，他却可以在临终祷告时说：上帝啊，我已经死而无憾了！因为他是一个尽职尽责的君王，终其一生，他都在为法兰西的强大而不懈努力。他深知自己不擅长具体事务的管理，所以他重用法国有史以来最伟大的政治家黎塞留，为此，他不惜跟自己的母亲、妻子、弟弟决裂，甚至牺牲自己，允许自己被黎塞留“架空”，并让黎塞留在生前生后都极尽荣耀（对比下张居正的下场）。在细节上，他显得平庸而缺乏主见，但是决定国家命运的关键时刻，他总能作出正确抉择，并且坚定不移地加以贯彻实行。
有这样一个真实的经典片断：路易十三临终前祈求上帝原谅自己为了国家而对家人冷酷无情，但他的王后却在儿子路易十四登基时说：要学你的祖父，他去世时法国人都痛哭；不要学你的父亲，他死时法国人都大笑。亨利四世是一个英明而且很有人格魅力的国王，人民为之哀痛理所当然。
但是路易十三去世时，法国人为什么而笑？亨利四世在位短，他虽然励精图治，但是留给路易十三的法国依然是千疮百孔、内忧外患、百废待兴；而路易十三去世后，留给路易十四的法国在内完成了政治、社会、宗教上的改革，国势蒸蒸日上，对外打垮了曾经无比强大的西班牙帝国和神圣罗马帝国，奠定了法国日后称霸欧陆的基础。
1643年5月路易十三因骑马落水引起的肺炎突然恶化，就在路易十三去世前几天，堂兄孔代亲王前来看望国王。路易十三很高兴的对亲王说，感谢您还把我当作亲人，西班牙知道了红衣主教黎塞留去世，我又身患重病，他们想乘火打劫，不过我刚刚做了一个梦，您的儿子昂吉安公爵把他们打得落花流水，法兰西取得了前所未有的胜利，这是一个好兆头。（传言路易十三一生预言了很多重大事件，例如他曾预言瑞典国王古斯塔夫.阿道夫将不能活着回到瑞典，又曾预言自己的妹夫英格兰与苏格兰国王查理一世将不得善终。）实际上西班牙此时发动了困兽的最后反扑，王牌之师佛兰德尔军乘着法国中央换届、内部不稳，再一次入侵法国，在御前紧急作战会议上，百官们却推选不出适合的统帅，因为大将们此时都身处各个战场。最后国王路易十三力排众议，他让孔代亲王之子此时不满22岁的昂吉安公爵挂帅出征，也就此让这位未来的“大孔代亲王”开始了自己的不世战功。也因此在他离世时，贵族重新活跃起来，形成了以孔代亲王、谢弗勒斯夫人、隆格威尔夫人为核心的投石党。
1643年5月14日所有人都知道国王陛下的大限已到。国王在临终前不停的为自己祷告，反复请求上帝原谅自己为了国家而对家人的冷酷无情。他恳求大臣与贵族们辅佐王后摄政直到太子成年。当祷告牧师问到，陛下还有什么要说的时，路易十三以近乎无畏的口气说到，上帝啊，我已经死而无憾了！希望您能继续保佑法兰西与我的儿子。不久国王就在安详中去世，终年42岁。不满5岁的太子在母亲的怀中被宣布为法兰西国王，开始了这个孩子长达72年的国王生涯……
