如何用4行 R 语句,快速探索你的数据集?

用最简单的方式,完成探索性分析。

痛点

实践中,大量数据分析时间,都会花在数据清洗与探索性数据分析(Exploratory Data Analysis, EDA)。即缺失值统计处理,和变量分布可视化。

数据采集过程中,可能有缺失。

你需要了解缺失数据的多少,以及它们可能对后续分析造成的影响。

如果某个变量的缺失数据少,干脆把含有缺失值的行(观测)扔掉就算了,免得影响分析精确程度。

但如果缺失数据太多,都扔掉就不可行了。你需要考虑如何进行填补。是用0,用 "unknown" ,还是使用均值或中位数?

另外,你可能还想看看每个特征变量的分布情况。

例如定量数据是正态分布,还是幂律分布?这对你后面合理进行研究假设,都是有影响的。

即便是对于分类数据,你也要了解独特取值(unique values)的个数,以便做到心中有数。

这些工作很有必要。但是实现起来,却一直很麻烦。即便是 R 这样专门给统计工作者使用的软件,从前也需要调用若干条命令(一般跟特征变量个数成正比),才能完成。

我最近发现了一款 R 包,可以非常方便地进行数据集总结概览。只要一条语句,就帮你完成探索性数据分析中的许多步骤。

通过本文,我把它分享给你。希望对你的数据分析工作有帮助。

演示

你不需要安装任何软件。只需要点击这个链接http://t.cn/Rg1JFfo),就可以使用 R 编程环境了。

等准备工作完毕,你会看到,浏览器里面开启了一个 RStudio 界面。

点击左上角的 File -> New File ,选择菜单里面的第一项 R Script

此时,你会看到左侧分栏一个空白编辑区域开启,可以输入语句了。

输入之前,我们先给文件起个名字。点击 File -> Save 按钮。

在新出现的对话框里面,输入 demo ,回车。

我们一共需要如下输入4条语句。你可以直接复制粘贴进编辑区域。

library(tidyverse)
library(summarytools)
flights <- read_csv("https://gitlab.com/wshuyi/demo-data-flights/raw/master/flights.csv")
view(dfSummary(flights))

分别解释一下含义。其实前3行语句,都是准备工作。真正总结概览功能,只需第4条。

第一行: tidyverse 是一个非常重要的库。可以说它改进了 R 语言处理数据的生态环境。而这个库中的大部分工具,都是 Hadley Wickham 一己之力推动和完成的。

第二行: summarytools 是我们今天用来总结概览数据的软件包名称。

第三行: 使用 read_csv 做数据读入。我们是从这个网址读取的,并且把数据存储到 flights 变量中。

你可以点击该链接http://t.cn/Rg1XCCN),下载原始数据 csv 文件,查看其内容。

这个数据集,来自于 Hadley Wickham 的 github 项目,名称叫做 nycflights13

它记录的是 2013 年,纽约市3大机场(分别为: JFK 肯尼迪国际机场、 LGA 拉瓜迪亚机场,和 EWR 纽瓦克自由国际机场)起飞的航班信息。

具体的记录信息(特征列),包括起飞时间、到达时间、延误时常、航空公司、始发机场、目的机场、飞行时长,和飞行距离等。

这个表格,看起来已经是很清晰的了。但是,由于观测(行)数量众多,我们很难直观分析出缺失值的情况,以及数据的分布等信息。

第4条语句,就是负责帮助我们更好地检视和探索数据用的。它用 dfSummary 函数处理 flights 数据框的内容,然后用 view 函数直观输出给用户。

点击 Code -> Run Region -> Run All 命令,运行代码。

运行中,可能会有一些警告信息。别理它就好。

分析的结果,在右下方的显示区域。因为区域比较小,内容却很多,看不全面。

你可以点击这个区域左上方第三个按钮 Show in new window ,在浏览器新窗口打开完整的显示结果。

解读

因截图篇幅关系,一张图中,无法显示完整信息。就着第一屏,给你讲解一下都有哪些分析结果。

  • 第一列是序号。不用理会。
  • 第二列是变量名称,以及变量的类型。例如 integer 指的是整数类型的定量数据;character 是字符串类型,也就是分类数据。
  • 第三列是统计结果。对于定量数据,直接汇报最大、最小、均值、中位数等信息。
  • 第六列是有效值个数;与其互补,第七列是缺失值个数。
  • 第四列是频数。显示每一个变量对应独特取值出现的情况。
  • 第五列最有意思,直接绘制分布统计图形。

我们翻到下一页看看。

可以看出,起飞延误是个典型的幂律分布。

到达延误,和的起飞延误分布长得很像,想想似乎很有道理。

但到达延误的分布类别是什么呢?为什么二者会有差异呢?

这个问题,供你思考。

探索

本文介绍的 summarytools 包的功能,并不只是对数据集做总体总结概览。

它还可以进行变量之间的关系展示。例如你想知道3大机场起飞的航班,对应航空公司的比例是否有差别。可以用一条语句,就得到这样的一张分析表格:

想自己动手,做出这样一张分析表格?请你点击这个链接(https://github.com/dcomtois/summarytools),阅读文档,了解 summarytools 的更多功能。

喜欢请点赞。还可以微信关注和置顶我的公众号“玉树芝兰”(nkwangshuyi)

如果你对数据科学感兴趣,不妨阅读我的系列教程索引贴《如何高效入门数据科学?》,里面还有更多的有趣问题及解法。

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 204,732评论 6 478
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 87,496评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 151,264评论 0 338
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,807评论 1 277
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,806评论 5 368
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,675评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 38,029评论 3 399
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,683评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 41,704评论 1 299
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,666评论 2 321
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,773评论 1 332
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,413评论 4 321
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 39,016评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,978评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,204评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 45,083评论 2 350
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,503评论 2 343

推荐阅读更多精彩内容