碳水化合物活性酶数据库(CAZy)
提供了酶分子序列的家族信息,物种来源,基因序列,蛋白序列,三维结构,EC分类,相关数据库链接……
建立此数据库是为了将酶分子的序列、结构、催化机制相关联~
分类
通过序列相似性进行家族分类,在这6个大的分类下可继续分为更为细致的亚类。
名称 | 缩写 |
---|---|
糖苷水解酶类 | GHs |
糖苷转移酶类 | GTs |
多糖裂解酶类 | PLs |
糖水化合物脂酶类 | CEs |
碳水化合物结合模块 | CBMs |
辅助模块酶类 | AAs |
名称说明
使用
CAZy的官网只提供了web查找的方法,如果需要本地化,需要自行爬取数据或者使用dbCAN的数据.
下载数据的说明