功能1:序列编辑
- 首先,要讲一条使用mega打开序列文件的技巧:直接将要分析的文件拖到mega软件的图标上,然后就是下面这个界面了。
- 在第一列选中序列名称,就可以对序列名称进行编辑,剪切和删除的修改。
- 此外,点击Species/Abbrv,可以对序列按名称顺序进行排列,非常方便。
功能2:序列比对
- 点击顶部功能栏的Alignment,一般选择下面的第一个,cluster w,也可以直接选择顶部一个大写 W 的快捷键,进行序列比对。
- 接下来,软件会提示,没有序列被选中,是否选择所有序列,点击ok选择所有序列进行比对。
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接下来,会弹出一个参数设置的界面,我们一般不做修改,直接点击ok,进行下一步。
- 之后,会出现下面这个界面,显示序列比对的进度。
- 序列比对完成以后,我们可以通鼠标过拖动序列顶部来选中不同的列,进行删除,以达到截齐比对结果两端的目的(非必需步骤),大致就是这样。关于构建进化树的功能将在后面讲到。
https://max.book118.com/html/2018/1101/6123030034001225.shtm
https://www.renrendoc.com/paper/99854631.html
https://jingyan.baidu.com/article/358570f6a48ce5ce4724fcf2.html