Matlab与C/C++混合编程 Matlab调用C函数

作者博客:bot7.cc

Matlab与C/C++混合编程有很多种方式,分别适用于不同的情况。

  1. 程序主体用Matlab编写,有一些特别耗时的函数用C/C++改写来提高效率,或者已经有现成的C/C++函数,应用到Matlab程序中(本文属于这种情况)
  2. 程序主体用C/C++编写,部分程序想调用Matlab函数减少开发时间,本文不涉及这种情况,建议读者自行查阅Matlab帮助文档

一点点废话

Matlab有着非常详细的帮助文档,建议直接阅读其帮助文档,市面上很多Matlab书籍都是简单的翻译翻译帮助文档,例子都是照抄,还有很多错误和断章取义的地方,参考这样的书籍容易被带上弯路。

打开Matlab,按F1打开帮助,此部分内容在:

MATLAB->Advanced Software Development->MATALB API for Other Languages

什么是MEX-file

简单来说MEX-file是一种预编译的,用其他语言(C/C++,Fortran)编写的函数库,可以直接被Matlab调用。

正如前面提到的,这种方式适用于两种情况:

  1. 程序中有一部分代码耗时巨大,想通过改写这部分函数提高速度
  2. 已经有大量C/C++或Fortran的函数库,想直接用Matlab调用,避免重复开发

这两种情况用MEX-file的这种方案来解决都是非常合适的,因为这种调用方式非常方便,你需要注意地只是数据结构的转换。这种方式支持C/C++和Fortran,本文主要将C/C++。

如何创建可供Matlab直接调用的MEX-file

1.安装Matlab支持的编译器

在Matlab命令窗口输入:

mex -setup

如果你的电脑已经安装了Matlab支持的编译器,这时候你应该会看到设置编译器的提示命令,跟着一步步下去就可以了。

注意:如果你电脑只安装了一个支持的编译器,这一步会自动用此编译器进行配置,如果有多个支持的编译器,Matlab会引导你选择要使用哪个编译器。
如果你电脑没有安装合适的编译器,会得到一个错误,提示你安装合适的编译器,并给出一个支持编译器列表的链接。

2.创建.c/.cpp文件

这一步可以用Matlab的编辑器也可以用其他你喜欢的编辑器,需要注意的是:
将来在Matlab中调用的函数名即为此处你创建的文件名,而不是文件内的函数名

MEX-file的内容

一个完整的MEX-file应该包括:

  • #include <mex.h> MEX-file头文件
  • mexFunction 入口函数(C/C++中的main函数)
  • 输入输出的数据的校验
  • 变量的传递
  • 你自己编写的功能函数

mexFunction 入口函数

void mexFunction( int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray *prhs[]);

此函数是MEX-file的入口函数,形式比较固定,起着C/C++语言中main函数的作用,建议放在整个文件的最后。

mexFunction函数中一般只做数据的转换和其他函数的调用,不做复杂的处理。

  • prhs -函数右侧,输入参数
  • plhs -函数左侧,输出参数
  • nrhs -函数右侧,输入参数的个数
  • nlhs -函数左侧,输出参数的个数

例如:在Matlab中用[a,b]=myMEX(c,d,e)的形式调用的函数,则nrhs==3 代表有三个输入参数,nlhs==2代表有两个输入参数,参数值分别储存在prhsplhs中。
输入输出数据的校验

这一部分建议放在mexFunction里面,校验输入输出参数的个数是否符合要求,校验输入参数的类型是否符合要求。

这里的输入参数是 只读 的,不要尝试更改,不然会引起错误。

创建一个可更改的输入参数的副本myData并调用mxDuplicateArray函数:

mxArray *myData = mxCreateStructMatrix(1,1,nfields,fnames);
mxSetField(myData,0,"myFieldName",mxDuplicateArray(prhs[0]));

对于输入参数类型的校验可以用mxIsClass中的函数来进行:

if(mxIsSparse(prhs[1])||mxIsComplex(prhs[1])||mxIsClass(prhs[1],"char")) {
  mexErrMsgTxt("input2 must be full matrix of real values.");
}

完整的mxIsClass函数列表见附录。

3.变量的传递

这一部分主要涉及如何将输入参数中的数据传出,并且用C/C++的数据结构来表示,以及如何构建输出参数,将运算结果传回Matlab。

由于Matlab中数据结构种类比较多,且比较复杂,这里并不会一一涉及,只介绍几种比较常用的数据类型,其他数据类型大家可以自行查阅Matlab帮助文档。

以下的示例代码都假设你需要传递的输入参数是第一个,如果为其他,只需修改prhs的角标即可

标量的传递

size_t mrows;  //行数
size_t ncols;  //列数
double scalar; //接收输入参数的变量

mrows = mxGetM(prhs[0]); //获取矩阵行数
ncols = mxGetN(prhs[0]); //获取矩阵列数

/*校验输入是否是一个标量*/
if( !mxIsDouble(prhs[0]) || mxIsComplex(prhs[0]) || !(mrows==1 && ncols==1) ) {
  mexErrMsgIdAndTxt( "MATLAB:timestwo:inputNotRealScalarDouble","Input must be a noncomplex scalar double.");
}

scalar = mxGetScalar(prhs[0]); //获取标量值

矩阵的传递

size_t mrows;    //行数
size_t ncols;    //列数
mxArray *inMat;  //接收输入参数的指针

mrows = mxGetM(prhs[0]); //获取矩阵行数
ncols = mxGetN(prhs[0]); //获取矩阵列数

/*校验输入是否是一个3*4的double矩阵
矩阵维数的校验也可以去掉(相应的你的处理函数要有处理不同大小矩阵的能力)*/
if( !mxIsDouble(prhs[0]) || mxIsComplex(prhs[0]) || !(mrows==3 && ncols==4) ) {
  mexErrMsgIdAndTxt( "MATLAB:timestwo:inputNotRealScalarDouble", "Input must be a noncomplex double matrix.");
}

/*获取输入矩阵的指针*/
inMat = mxGetPr(prhs[0]);

为输出变量分配内存并传递给mexFunction的输出参数

mxArray *outMat;
outMat  = mxCreateDoubleMatrix((mwSize)mrows,(mwSize)ncols,mxREAL);
plhs[0] = outMat;

这里需要注意的是Matlab中矩阵的储存是列优先的,而C语言中是行优先的,在调用矩阵元素时需要注意:

double result;

/* 将iMat中的第 i行 j列的元素值赋给result */
result = inMat[j*mrows+i]

为输出变量分配内存并传递给mexFunction的输出参数

mxArray *outMat;
outMat  = mxCreateDoubleMatrix((mwSize)mrows,(mwSize)ncols,mxREAL);
plhs[0] = outMat;

字符串的传递

将输入参数转换为C-typestring

string input_buf;
input_buf = mxArrayToString(prhs[0]);

为输出字符串分配内存

string output_buf;
output_buf=mxCalloc(buflen, sizeof(char));

将输出字符串传递给输出参数

plhs[0] = mxCreateString(output_buf);

最后释放内存

mxFree(input_buf);

Structure和Cell类型的传递

StructureCell类型的传递其实与其他类型相似,他们是mxArray类型。

mxGetFieldmxGetCell函数可以用来获取指向StructureCell类型内容的mxArray类型的指针。

mxGetNumberOfFieldsmxGetNumberOfElements可以用来获取Structure的条目的个数和元素的个数。

mxGetData函数可以用来获取mxArray变量中包含的数据。

因为Matlab中Cell的应用比Structure频繁,并且这两者结构数据传递方式很类似,此处以Cell进行讲解:
假设我们的输入参数Cell中第一个元素是一个1x3的矩阵,第二个元素还是一个Cell,这个Cell里面包含两个1x3的矩阵,在Matlab中构建方法如下:

temp    = [];
temp{1} = [1:3];
temp{2} = [4:6];

Cell    = [];
Cell{1} = [1:3];
Cell{2} = temp;

现在我们如果我们想将Cell传入MEX-file中进行处理,读出Cell中第第一个元素[1:3]和第二个元素temp,这个元素还是一个Cell,这在Matlab中很常见,可以如下操作:

mxArray *mat;   //指向第一个元素[1:3]的指针
mxArray *Cell;  //指向第二个元素的指针,还是一个Cell
size_t nrows;   //行数
size_t ncols;   //列数
double *data;     //数据

int i; //循环变量
int j;

/* 获取输入Cell的维数 */
mrows = mxGetM(prhs[0]);
ncols = mxGetN(prhs[0]);
/* 输出Cell的维数,这里作为示例我并没有保存Cell的维数,后面获取Cell中元素维数时还是用的这两个变量 */
mxPrintf("rows:%d,cols:%d\n",mrows,ncols);

/* 取出Cell中第一个元素,此处mat是一个指向矩阵的mxArray指针,data储存的是数据 */
mat = mxGetCell(prhs[0],0);
data = (double*)mxGetData(mat);

/* 打印矩阵内的元素 [1:3]*/
mrows = mxGetM(mat);
ncols = mxGetN(mat);

for (i=0;i<mrows;i++)
{
    for (j=0;j<ncols;j++)
    {
        mxPrintf("%f    ",data[j*M+i]);
    }
    mxPrintf("\n");
}

/* 取出Cell中第二个元素 还是一个Cell 再取出里面内容的方法与上述过程一致 继续调用mxGetCell */
Cell = mxGetCell(prhs[0],1);

关于在Mex-file中构建Cell的方法,这里不详细讲了,因为个人觉得这么做吃力不讨好,何不把数据分别传入Matlab再重新组织呢?如果你真的想要在MEX-file里面构建Cell并传出,原理是创建一个相应大小的mxArray,因为Cell本身就是mxArrary类型的,然后将这部分内存的地址传给plhs

MEX-file的编译和调用

将Matlab的当前目录切换到你MEX-file所在的目录,假设你的文件名为helloMEX.c,在Matlab命令窗口输入

mex helloMEX.c

如果得到MEX completed successfully.的提示即为编译成功,如果不成功,会显示错误的位置和原因,对应修改即可。

编译成功后会得到后缀为.mexw64的文件(后缀名与平台相关,此为win64下的后缀名,其他平台不同),将此文件添加入Matlab的路径中,或者将当前目录切换到此文件所在目录,即可像普通的Matlab函数一样调用此文件。

附录: mxIsClass 函数列表

(更详细的介绍参见Matlab帮助文档)

mxIsDouble() //Determine whether mxArray represents data as double-precision, floating-point numbers
mxIsSingle() //Determine whether array represents data as single-precision, floating-point numbers
mxIsComplex() //Determine whether data is complex
mxIsNumeric() //Determine whether array is numeric
mxIsInt64() //Determine whether array represents data as signed 64-bit integers
mxIsUint64() //Determine whether array represents data as unsigned 64-bit integers
mxIsInt32() //Determine whether array represents data as signed 32-bit integers
mxIsUint32() //Determine whether array represents data as unsigned 32-bit integers
mxIsInt16() //Determine whether array represents data as signed 16-bit integers
mxIsUint16() //Determine whether array represents data as unsigned 16-bit integers
mxIsInt8() //Determine whether array represents data as signed 8-bit integers
mxIsUint8() //Determine whether array represents data as unsigned 8-bit integers
mxIsChar() //Determine whether input is string array
mxIsLogical() //Determine whether array is of type mxLogical
mxIsLogicalScalar() //Determine whether scalar array is of type mxLogical
mxIsLogicalScalarTrue() //Determine whether scalar array of type mxLogical is true
mxIsStruct() //Determine whether input is structure array
mxIsCell() //Determine whether input is Cell array
mxIsClass() //Determine whether array is member of specified class
mxIsInf() //Determine whether input is infinite
mxIsFinite() //Determine whether input is finite
mxIsNaN() //Determine whether input is NaN (Not-a-Number)
mxIsEmpty() //Determine whether array is empty
mxIsSparse() //Determine whether input is sparse array
mxIsFromGlobalWS() //Determine whether array was copied from MATLAB global workspace
mxAssert() //Check assertion value for debugging purposes
mxAssertS() //Check assertion value without printing assertion text
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