Elasticsearch基本原理

es的底层数据结构

Elasticsearch 是通过 Lucene 的倒排索引技术实现比关系型数据库更快的过滤。特别是它对多条件的过滤支持非常好,比如年龄在 18 和 30 之间,性别为女性这样的组合查询。倒排索引很多地方都有介绍,但是其比关系型数据库的 b-tree 索引快在哪里?到底为什么快呢?

b-tree 索引是为写入优化的索引结构。当我们不需要支持快速的更新的时候,可以用预先排序等方式换取更小的存储空间,更快的检索速度等好处,其代价就是更新慢。要进一步深入的化,还是要看一下 Lucene 的倒排索引是怎么构成的。

image.png

这里有好几个概念。我们来看一个实际的例子,假设有如下的数据:

docid 年龄 性别
1 18
2 20
3 18

这里每一行是一个 document。每个 document 都有一个 docid。那么给这些 document 建立的倒排索引就是:
年龄

docid 年龄
18 [1,3]
20 [2]

性别

docid 性别
[1,2]
[3]

可以看到,倒排索引是per field的,一个字段由一个自己的倒排索引。18,20这些叫做 term,而[1,3]就是posting list。Posting list就是一个int的数组,存储了所有符合某个term的文档id。那么什么是term dictionary 和 term index?

假设我们有很多个term,比如:
Carla,Sara,Elin,Ada,Patty,Kate,Selena
如果按照这样的顺序排列,找出某个特定的term一定很慢,因为term没有排序,需要全部过滤一遍才能找出特定的term。排序之后就变成了:
Ada,Carla,Elin,Kate,Patty,Sara,Selena

这样我们可以用二分查找的方式,比全遍历更快地找出目标的term。这个就是 term dictionary。有了term dictionary之后,可以用 logN 次磁盘查找得到目标。但是磁盘的随机读操作仍然是非常昂贵的(一次random access大概需要10ms的时间)。所以尽量少的读磁盘,有必要把一些数据缓存到内存里。但是整个term dictionary本身又太大了,无法完整地放到内存里。于是就有了term index。term index有点像一本字典的大的章节表。比如:

A开头的term ……………. Xxx页

C开头的term ……………. Xxx页

E开头的term ……………. Xxx页

如果所有的term都是英文字符的话,可能这个term index就真的是26个英文字符表构成的了。但是实际的情况是,term未必都是英文字符,term可以是任意的byte数组。而且26个英文字符也未必是每一个字符都有均等的term,比如x字符开头的term可能一个都没有,而s开头的term又特别多。实际的term index是一棵trie 树:


image.png

例子是一个包含 "A", "to", "tea", "ted", "ten", "i", "in", 和 "inn" 的 trie 树。这棵树不会包含所有的term,它包含的是term的一些前缀。通过term index可以快速地定位到term dictionary的某个offset,然后从这个位置再往后顺序查找。再加上一些压缩技术(搜索 Lucene Finite State Transducers) term index 的尺寸可以只有所有term的尺寸的几十分之一,使得用内存缓存整个term index变成可能。整体上来说就是这样的效果。


image.png

现在我们可以回答“为什么Elasticsearch/Lucene检索可以比mysql快了。Mysql只有term dictionary这一层,是以b-tree排序的方式存储在磁盘上的。检索一个term需要若干次的random access的磁盘操作。而Lucene在term dictionary的基础上添加了term index来加速检索,term index以树的形式缓存在内存中。从term index查到对应的term dictionary的block位置之后,再去磁盘上找term,大大减少了磁盘的random access次数。

额外值得一提的两点是:term index在内存中是以FST(finite state transducers)的形式保存的,其特点是非常节省内存。Term dictionary在磁盘上是以分block的方式保存的,一个block内部利用公共前缀压缩,比如都是Ab开头的单词就可以把Ab省去。这样term dictionary可以比b-tree更节约磁盘空间。

如何联合索引查询?
所以给定查询过滤条件 age=18 的过程就是先从term index找到18在term dictionary的大概位置,然后再从term dictionary里精确地找到18这个term,然后得到一个posting list或者一个指向posting list位置的指针。然后再查询 gender=女 的过程也是类似的。最后得出 age=18 AND gender=女 就是把两个 posting list 做一个“与”的合并。

这个理论上的“与”合并的操作可不容易。对于mysql来说,如果你给age和gender两个字段都建立了索引,查询的时候只会选择其中最selective的来用,然后另外一个条件是在遍历行的过程中在内存中计算之后过滤掉。那么要如何才能联合使用两个索引呢?有两种办法:

  • 使用skip list数据结构。同时遍历gender和age的posting list,互相skip;
  • 使用bitset数据结构,对gender和age两个filter分别求出bitset,对两个bitset做AN操作。

Elasticsearch支持以上两种的联合索引方式,如果查询的filter缓存到了内存中(以bitset的形式),那么合并就是两个bitset的AND。如果查询的filter没有缓存,那么就用skip list的方式去遍历两个on disk的posting list。

利用 Skip List 合并

image.png

以上是三个 posting list。我们现在需要把它们用 AND 的关系合并,得出 posting list 的交集。首先选择最短的 posting list,然后从小到大遍历。遍历的过程可以跳过一些元素,比如我们遍历到绿色的 13 的时候,就可以跳过蓝色的 3 了,因为 3 比 13 要小。

整个过程如下


Next -> 2
Advance(2) -> 13
Advance(13) -> 13
Already on 13
Advance(13) -> 13 MATCH!!!
Next -> 17
Advance(17) -> 22
Advance(22) -> 98
Advance(98) -> 98
Advance(98) -> 98 MATCH!!!

最后得出的交集是 [13,98],所需的时间比完整遍历三个 posting list 要快得多。但是前提是每个 list 需要指出 Advance 这个操作,快速移动指向的位置。什么样的 list 可以这样 Advance 往前做蛙跳?skip list:


image.png

从概念上来说,对于一个很长的 posting list,比如:
[1,3,13,101,105,108,255,256,257]

我们可以把这个 list 分成三个 block:
[1,3,13] [101,105,108] [255,256,257]

然后可以构建出 skip list 的第二层:
[1,101,255]

1,101,255 分别指向自己对应的 block。这样就可以很快地跨 block 的移动指向位置了。

Lucene 自然会对这个 block 再次进行压缩。其压缩方式叫做 Frame Of Reference 编码。示例如下:

image.png

考虑到频繁出现的 term(所谓 low cardinality 的值),比如 gender 里的男或者女。如果有 1 百万个文档,那么性别为男的 posting list 里就会有 50 万个 int 值。用 Frame of Reference 编码进行压缩可以极大减少磁盘占用。这个优化对于减少索引尺寸有非常重要的意义。当然 mysql b-tree 里也有一个类似的 posting list 的东西,是未经过这样压缩的。

因为这个 Frame of Reference 的编码是有解压缩成本的。利用 skip list,除了跳过了遍历的成本,也跳过了解压缩这些压缩过的 block 的过程,从而节省了 cpu。

利用 bitset 合并
Bitset 是一种很直观的数据结构,对应 posting list 如:
[1,3,4,7,10]

对应的 bitset 就是:
[1,0,1,1,0,0,1,0,0,1]

每个文档按照文档 id 排序对应其中的一个 bit。Bitset 自身就有压缩的特点,其用一个 byte 就可以代表 8 个文档。所以 100 万个文档只需要 12.5 万个 byte。但是考虑到文档可能有数十亿之多,在内存里保存 bitset 仍然是很奢侈的事情。而且对于个每一个 filter 都要消耗一个 bitset,比如 age=18 缓存起来的话是一个 bitset,18<=age<25 是另外一个 filter 缓存起来也要一个 bitset。

所以秘诀就在于需要有一个数据结构:

  • 可以很压缩地保存上亿个 bit 代表对应的文档是否匹配 filter;
  • 这个压缩的 bitset 仍然可以很快地进行 AND 和 OR 的逻辑操作。

Lucene 使用的这个数据结构叫做 Roaring Bitmap。


image.png

其压缩的思路其实很简单。与其保存 100 个 0,占用 100 个 bit。还不如保存 0 一次,然后声明这个 0 重复了 100 遍。

这两种合并使用索引的方式都有其用途。Elasticsearch 对其性能有详细的对比( https://www.elastic.co/blog/frame-of-reference-and-roaring-bitmaps )。简单的结论是:因为 Frame of Reference 编码是如此 高效,对于简单的相等条件的过滤缓存成纯内存的 bitset 还不如需要访问磁盘的 skip list 的方式要快。

如何减少文档数?
一种常见的压缩存储时间序列的方式是把多个数据点合并成一行。
这个过程可以示例如下:

时间 数据
12:05:00 10
12:05:01 15
12:05:02 14
12:05:03 16

合并之后就变成了:

时间 col1 col2 col3 col4
12:05 10 15 14 16

可以看到,行变成了列了。每一列可以代表这一分钟内一秒的数据。

Elasticsearch有一个功能可以实现类似的优化效果,那就是Nested Document。我们可以把一段时间的很多个数据点打包存储到一个父文档里,变成其嵌套的子文档。示例如下:

{timestamp:12:05:01, idc:sz, value1:10,value2:11}
{timestamp:12:05:02, idc:sz, value1:9,value2:9}
{timestamp:12:05:02, idc:sz, value1:18,value:17}

可以打包成:

{
max_timestamp:12:05:02, min_timestamp: 1205:01, idc:sz,
records: [
        {timestamp:12:05:01, value1:10,value2:11}
        {timestamp:12:05:02, value1:9,value2:9}
        {timestamp:12:05:02, value1:18,value:17}
]
}

这样可以把数据点公共的维度字段上移到父文档里,而不用在每个子文档里重复存储,从而减少索引的尺寸。


image.png

在存储的时候,无论父文档还是子文档,对于 Lucene 来说都是文档,都会有文档 Id。但是对于嵌套文档来说,可以保存起子文档和父文档的文档 id 是连续的,而且父文档总是最后一个。有这样一个排序性作为保障,那么有一个所有父文档的 posting list 就可以跟踪所有的父子关系。也可以很容易地在父子文档 id 之间做转换。把父子关系也理解为一个 filter,那么查询时检索的时候不过是又 AND 了另外一个 filter 而已。前面我们已经看到了 Elasticsearch 可以非常高效地处理多 filter 的情况,充分利用底层的索引。

使用了嵌套文档之后,对于 term 的 posting list 只需要保存父文档的 doc id 就可以了,可以比保存所有的数据点的 doc id 要少很多。如果我们可以在一个父文档里塞入 50 个嵌套文档,那么 posting list 可以变成之前的 1/50。


es数据写入过程

image.png

说明

  • 客户端选择一个 node 发送请求过去,这个 node 就是 coordinating node (协调节点)。
  • coordinating node 对 document 进行路由,将请求转发给对应的 node(有 primary shard)。
  • 实际的 node 上的 primary shard 处理请求,然后将数据同步到 replica node 。
  • coordinating node 如果发现 primary node 和所有 replica node 都搞定之后,就返回响应结果给客户端。

写数据底层原理


image.png

先写入内存 buffer,在 buffer 里的时候数据是搜索不到的;同时将数据写入 translog 日志文件。

如果 buffer 快满了,或者到一定时间,就会将内存 buffer 数据 refresh 到一个新的 segment file 中,但是此时数据不是直接进入 segment file 磁盘文件,而是先进入 os cache 。这个过程就是 refresh 。

每隔 1 秒钟,es 将 buffer 中的数据写入一个新的 segment file ,每秒钟会产生一个新的磁盘文件 segment file ,这个 segment file 中就存储最近 1 秒内 buffer 中写入的数据。

但是如果 buffer 里面此时没有数据,那当然不会执行 refresh 操作,如果 buffer 里面有数据,默认 1 秒钟执行一次 refresh 操作,刷入一个新的 segment file 中。

操作系统里面,磁盘文件其实都有一个东西,叫做 os cache ,即操作系统缓存,就是说数据写入磁盘文件之前,会先进入 os cache ,先进入操作系统级别的一个内存缓存中去。只要 buffer 中的数据被 refresh 操作刷入 os cache 中,这个数据就可以被搜索到了。

为什么叫 es 是准实时的?NRT ,全称 near real-time 。默认是每隔 1 秒 refresh 一次的,所以 es 是准实时的,因为写入的数据 1 秒之后才能被看到。可以通过 es 的 restful api 或者 java api ,手动执行一次 refresh 操作,就是手动将 buffer 中的数据刷入 os cache 中,让数据立马就可以被搜索到。只要数据被输入 os cache 中,buffer 就会被清空了,因为不需要保留 buffer 了,数据在 translog 里面已经持久化到磁盘去一份了。

重复上面的步骤,新的数据不断进入 buffer 和 translog,不断将 buffer 数据写入一个又一个新的 segment file 中去,每次 refresh 完 buffer 清空,translog 保留。随着这个过程推进,translog 会变得越来越大。当 translog 达到一定长度的时候,就会触发 commit 操作。

commit 操作发生第一步,就是将 buffer 中现有数据 refresh 到 os cache 中去,清空 buffer。然后,将一个 commit point 写入磁盘文件,里面标识着这个 commit point 对应的所有 segment file ,同时强行将 os cache 中目前所有的数据都 fsync 到磁盘文件中去。最后清空 现有 translog 日志文件,重启一个 translog,此时 commit 操作完成。

这个 commit 操作叫做 flush 。默认 30 分钟自动执行一次 flush ,但如果 translog 过大,也会触发 flush 。flush 操作就对应着 commit 的全过程,我们可以通过 es api,手动执行 flush 操作,手动将 os cache 中的数据 fsync 强刷到磁盘上去。

translog 日志文件的作用是什么?你执行 commit 操作之前,数据要么是停留在 buffer 中,要么是停留在 os cache 中,无论是 buffer 还是 os cache 都是内存,一旦这台机器死了,内存中的数据就全丢了。所以需要将数据对应的操作写入一个专门的日志文件 translog 中,一旦此时机器宕机,再次重启的时候,es 会自动读取 translog 日志文件中的数据,恢复到内存 buffer 和 os cache 中去。

translog 其实也是先写入 os cache 的,默认每隔 5 秒刷一次到磁盘中去,所以默认情况下,可能有 5 秒的数据会仅仅停留在 buffer 或者 translog 文件的 os cache 中,如果此时机器挂了,会丢失 5 秒钟的数据。但是这样性能比较好,最多丢 5 秒的数据。也可以将 translog 设置成每次写操作必须是直接 fsync 到磁盘,但是性能会差很多。

总结一下,数据先写入内存 buffer,然后每隔 1s,将数据 refresh 到 os cache,到了 os cache 数据就能被搜索到(所以我们才说 es 从写入到能被搜索到,中间有 1s 的延迟)。每隔 5s,将数据写入 translog 文件(这样如果机器宕机,内存数据全没,最多会有 5s 的数据丢失),translog 大到一定程度,或者默认每隔 30mins,会触发 commit 操作,将缓冲区的数据都 flush 到 segment file 磁盘文件中。


es 读数据过程

可以通过 doc id 来查询,会根据 doc id 进行 hash,判断出来当时把 doc id 分配到了哪个 shard 上面去,从那个 shard 去查询。

  • 客户端发送请求到任意一个 node,成为 coordinate node 。
  • coordinate node 对 doc id 进行哈希路由,将请求转发到对应的 node,此时会使用 round-robin 随机轮询算法,在 primary shard 以及其所有 replica 中随机选择一个,让读请求负载均衡。
  • 接收请求的 node 返回 document 给 coordinate node 。
    coordinate node 返回 document 给客户端。

es 搜索数据过程

es 最强大的是做全文检索,就是比如你有三条数据:

java真好玩儿啊
java好难学啊
j2ee特别牛

你根据 java 关键词来搜索,将包含 java 的 document 给搜索出来。es 就会给你返回:java 真好玩儿啊,java 好难学啊。

  • 客户端发送请求到一个 coordinate node 。
  • 协调节点将搜索请求转发到所有的 shard 对应的 primary shard 或 replica shard ,都可以。
  • query phase:每个 shard 将自己的搜索结果(其实就是一些 doc id )返回给协调节点,由协调节点进行数据的合并、排序、分页等操作,产出最终结果。
  • fetch phase:接着由协调节点根据 doc id 去各个节点上拉取实际的 document 数据,最终返回给客户端。

备注:写请求是写入 primary shard,然后同步给所有的 replica shard;读请求可以从 primary shard 或 replica shard 读取,采用的是随机轮询算法。


删除/更新数据底层原理

如果是删除操作,commit 的时候会生成一个 .del 文件,里面将某个 doc 标识为 deleted 状态,那么搜索的时候根据 .del 文件就知道这个 doc 是否被删除了。

如果是更新操作,就是将原来的 doc 标识为 deleted 状态,然后新写入一条数据。

buffer 每 refresh 一次,就会产生一个 segment file ,所以默认情况下是 1 秒钟一个 segment file ,这样下来 segment file 会越来越多,此时会定期执行 merge。每次 merge 的时候,会将多个 segment file 合并成一个,同时这里会将标识为 deleted 的 doc 给物理删除掉,然后将新的 segment file 写入磁盘,这里会写一个 commit point ,标识所有新的 segment file ,然后打开 segment file 供搜索使用,同时删除旧的 segment file 。

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