《学习小组Day3笔记--逐日鲁班》
今日学习的内容总的来说就是软件的安装与使用，这个软件就像我们平时用的apple store一样，先安装conda,然后在里面寻找软件，安装命令就不赘述了，和教程一样，安装linux 下的包就行了
主要概括几个安装命令
1. 激活conda
source ~/.bashrc
2. 选择源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
3.查看软件列表
conda list
4.安装软件 卸载软件 安装指定版本
conda install fastqc -y
conda remove fastqc -y
conda install conda install fastqc=0.11.7 -y
5.conda 环境理解，即各自的圈子，需要配置不同的类型
conda info --envs #环境查看
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y #建立python3 安装环境下名为rna-seq的环境
conda activate rna-seq #激活rna-seq环境变量，更改默认环境为rna-seq 输入文件名，提示文档，为安装成功；默认base,可以退出然后激活指定
conda deactivate rna-seq #退出conda
Tips:
1.conda update conda #更新conda
2.conda update --all #更新all
3.source activate+环境名 #激活环境
4.conda remove -n 环境名 或者all # 移除环境
5.conda remove 环境名 package_name#移除包
