【文献简报】Cumulus 为大规模单细胞RNA测序提供云数据分析

单细胞数量越来越多,上云分析成了必不可少的道路,单细胞大数据分析是未来的趋势,
大规模平行的单细胞和单核RNA测序为健康和疾病中的系统组织图谱开辟了道路,但是随着数据生成规模的不断增长,对用于规模化分析的计算途径是迫切需要的。在此,研究人员开发了Cumulus——一款用于进行大规模单细胞和单核RNA测序数据集分析的云框架。Cumulus 通过将云计算的功能与算法和执行方面的改进相结合,实现了高扩展性,低成本,用户友好性以及对一系列功能的集成支持。我们在骨髓细胞的免疫细胞数据集的人类细胞图谱中对Cumulus进行了基准测试,结果表明Cumulus比常规计算框架的效率有显著提升,同时维持或改善了结果的质量,从而可以进行大规模研究。



文献参考:【PMID】32719530

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