Kuang 1999标记 检测近交衰退基因

  1. Kuang H, Richardson TE, Carson SD, Bongarten BC. Genetic analysis of inbreeding depression in plus tree 850.55 of Pinus radiata D. Don. II. Genetics of viability genes. Theor. Appl. Genet. 1999;99:140–6.

大多数针叶类物种表现出严重的近交衰退。自交个体通常具有降低的存活力,减少的活力和形态学缺陷。 辐射松优株850.55自交后filled种子的数量是其异交数量的48%,自交幼苗的26.1%在早期死亡。研究了172个标记(覆盖56%的基因组)在辐射松优树850.55的自交后代中的分离。基于标记的分离比,鉴定与近交繁殖对生存力相关的基因(P(0.05)。使用期望/条件最大化(ECM)算法,我们估计生活力基因的位置,优势程度和选择系数。发现了9个估计生活力基因,其中7个是显性的,一个是部分显性的(优势度为“0.4”),另一个基因是超显性的或伪上超显性的,其中两个纯合子的选择系数分别为0.4和0.42。在显示优势或部分优势的基因中,7个是亚致死的,选择范围从0.55到0.79;一个基因(SDPr),负责幼苗死亡在发芽后的第一个月内,是致命的。


介绍
大多数针叶树种,如其他异交种,表现出近交衰退(Williams和Savolainen 1996综述)。近交衰退可以以许多方式表现。在种子中,树种可能具有减少的种子产量,种子可以具有较低的发芽率,并且幼苗可以具有较高的异常百分比,较低的存活率和减少的生长。filled种子的产量降低是其中的最一致和严重的结果之一(Bingham和Squillace 1955; Snyder 1968; Sorensen 1971; Sorensen和Miles 1974; Fowler和Park 1983; Gri $ n和Lindgren 1985)。通常认为纯合的致死或亚致死等位基因负责在自交(Orr-Ewing 1957; Sarvas 1962; Hagman和Mikkola 1963; Mergen等人1965)时产生空种子,但直接证据是罕见的(Fowler 1964,1965; Hedrick和Muona 1990)。根据近亲近交衰退对生存力(种子生产,在大多数情况下)的程度,已经估计许多针叶树种的致死当量数(Williams和Savolainen 1996)。然而许多涉及的基因是未知的。致死当量的数目是仅当隐性纯合子完全致死时所涉及的基因数目的近似估计。另一方面,许多更多的基因可能正在操作。通过分子标记,可以鉴定完全致死和亚致死等位基因,并且可以研究它们的遗传性质。在自然选择后,家系中有害的基因型应该以比Men- delian比例预期的更低的频率存在。紧密连锁的分子标记物也应该显示失真的孟德尔比。标记的分离失调提供了关于连锁的有害等位基因的位置和遗传效应的信息。 Hedrick和Muona(1990)使用最大可能方法对自交系中一个同工酶标记(#umorescent esterasase)的分离数据鉴定苏格兰松中的有害等位基因。最近开发了更复杂的利用两个共同显性标记的分离数据的方法。 Cheng et al。 (1996)使用期望/条件最大化(ECM)方法来研究水稻的生存力基因。辐射松(Pinus radiata)已成为其中之一
最经济上重要的树种在世界上。 Plus树850.55已被证明是所有辐射松选择中生长速率最好的。不幸的是,辐射松像大多数针叶树一样,表现出显着的近亲近交衰退(Wilcox 1983; Gri $ n和Lindgren 1985),预计这将表现为轮回选择继续。每个锥体的种子数在sel“ng plus tree 850.55之后是异交的48%; S中的种子数量是S的48%(Gri $ n和Lindgren 1985)。在这里提出的研究中,基于随机扩增多态性DNA(RAPD)和微卫星标记的分离数据,研究了辐射虫基因组+树850.55基因组中的有害等位基因,支配性程度和相应的活力基因的选择系数。

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