JupyterLab中新建一个seruat分析环境

  1. 默认已经安装conda，新建一个环境，名字叫seurat

    conda create -n seurat

  2. 进入环境

    source activate seurat

  3. 安装seurat

    conda install -c conda-forge r-seurat

  4. 将这个环境加入jupyterLab, 为新的内核起个名字seurat

    conda install -c conda-forge r-irkernel
conda install -c anaconda jupyter_client
cd R
# 进入R环境
> IRkernel::installspec(name = 'seurat', displayname = 'Seurat')

  5. 添加成功，可在jupyterlab中选择相应内核。

此方法也可以应用到添加其他R的内核

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