大唐武德七年，唐高祖李渊带着两个儿子李世民和李元吉，一起前往长安以北宜君县境内的仁智宫避暑。太子李建成则留守长安监国。
然而，就在李渊父子三人到了仁智宫不久，突然来了两个不速之客，李渊在接见这两人之后，立刻下令，带着嫔妃和近臣在卫兵的保护下进入玉华山深处“行猎”，说是行猎，但看众人匆忙惊慌的样子，怎么看怎么像逃难。四天以后，李渊在秦王李世民的劝说下回到了行宫，猎物没打到几个，但头发却白了不少。
来的这两个人，一个叫乔公山，一个叫尔朱焕，都不过是无名之辈，但他们的身份很特殊，是东宫的两名卫率统军，而他们所告发的事情更加惊人：太子李建成联合庆州都督杨文干准备谋反！
根据两人供述，东宫左卫率韦挺命他们悄悄押送一批崭新的盔甲前往庆州，收货人正是太子的心腹、庆州都督杨文干。两人途径豳州的时候，突然向当地官员举报，豳州地方官不敢擅作主张，于是将二人送到李渊所在的仁智宫。
太子谋反，这是惊天大案！恰在此时，一个叫杜凤举的人也跑到仁智宫告发太子打算谋反。两相对照，再加上一堆盔甲为物证，李渊也不得不相信太子李建成，是真的谋反了！
六月初五，李渊下旨召正在长安监国的李建成到仁智宫见驾，三天之后面色苍白的李建成来到仁智宫，李渊在行宫大殿当中大骂太子忤逆不孝，李建成惶恐不能自辩，在御前连连磕头请罪，几乎身死，声称暗送盔甲之事则有，谋反之事则无。最终，李渊将其软禁起来，每日仅以粗粮清水供给。
第二天，李渊派司农卿宇文颖前往庆州召杨文干入朝对质。然而，当宇文颖到庆州之后，却将所有事情向杨文干和盘托出，杨文干意识到自己无论是否奉诏都是死路一条，于是决定在庆州举兵造反，然而这却变相印证了太子李建成有谋反意图。
形势危急之下，李渊召见秦王李世民，准备让李世民前去平叛。但李世民却推辞了，他说，“儿臣掌管天下兵马，一旦兵出庆州，只怕天下震动，杨文干不过疥癣之疾，随便派个武将就可以平定了。”
李渊明白这个二儿子的心思，如今李世民已经是天策上将，真正到了“功高不赏”的地步，如果这次平叛成功，自己还能赏他什么呢？于是对李世民说道，“太子谋反，非同小可，只有你去办我才能放心。等你办完了这件事情回来，朕便颁制中外，立你为太子……”
得到了父亲的承诺，李世民带兵平叛去了，一个小小的杨文干，对百战百胜的秦王李世民来说，自然不过是手到擒来。然而，在李世民走后，朝廷的局势却突然大变。
六月廿六日，秦王府两名护军将领秦叔宝、程知节击破百家堡，降一千八百人。次日清晨，大军将署名为“秦王李世民”的劝降书射入庆州城中。一个半时辰之后，庆州城门大开，李世民接管了庆州。但杨文干在此之前，便在身边校尉的逼迫下拔刀自尽了。
然而，当李世民胜利班师回到仁智宫时，却早已人去楼空，李渊一行早已回到了长安，对此李世民竟然一无所知。
紧接着，封李世民为太子的诏书没有下来，却有三颗人头挂了出来，正是举报太子谋反的乔公山、尔朱焕、杜凤举三人。
七月初七，李渊下诏，杨文干诛三族，东宫中允王珪、太子左卫率韦挺远发邛州，天策上将府兵曹参军杜淹，也被流放。
杜淹就是杜如晦的叔父。原本是太子谋反的大案，最终却处置了秦王府的人，这说明无论“杨文干”事件真相如何，李渊已经倒向了太子李建成。也正是从此之后，李世民在与李建成集团的争斗中，始终落于下风。
李建成认为，“秦王府中能让人担心的，只有房玄龄和杜如晦两人。”若想除掉李世民，首先需要拿掉他的两个“智囊”-房玄龄、杜如晦，由此让李世民阵脚大乱，然后方可一举成功。为此，李建成便在唐高祖面前百般谗毁房玄龄、杜如晦，并成功地说服李渊将二人驱逐出秦王府，并不得私自拜谒李世民。消息一出，秦王府上下大惊失色，但又无可奈何。
随着李建成的逼迫日甚一日，李世民越发焦虑无计。
武德九年六月，突厥再次入侵大唐，李建成建议李元吉率兵抗击。而李元吉则趁机征调了秦王府的干将和兵马，彻底将李世民架空，并且，李元吉还计算在出征仪式上埋伏下杀手，等到李世民来送行时一举将其刺杀。
这是一个疯狂而大胆的计划，要知道在大军出征仪式上，不仅李世民要去，太子李建成也要去，唐高祖李渊也是要去的，可以说一家人整整齐齐的都会在场。而李元吉的计划，是当着父亲和大哥的面，杀掉二哥，不知这个计划的后续，是不是杀掉李世民之后，下一个对象会不会就是李建成和李渊呢？
但是，这个计划被李世民事先知道了，他感到太子集团的刀已经驾在了自己的脖子上，如果不想把自己和家人的脑袋双手奉上，只有发动绝地反击了！但如何反击，却需要有人来为他谋划，李世民第一个想到的，就是被驱逐出秦王府的房玄龄和杜如晦。
于是，李世民就派大舅哥长孙无忌暗中去请房玄龄、杜如晦，让他们帮助自己筹划应对之策。然而，长孙无忌去了之后，房杜二人却说，“当初皇上将我们驱逐出秦王府，并终生不得事亲王，言犹在耳。如今秦王私自召见，恐怕祸及家人，所以我等不敢去。”
长孙无忌如实禀报，李世民听后大怒，认为两人这是要背叛自己，改换门庭，于是摘下身上的佩刀，交给尉迟敬德，命其火速赶往房、杜二人的住处，让他们务必尽快赶来议事，若对方依然不肯听命，便即刻将他们杀死，然后携带首级回来复命。
但是很快李世民就冷静了下来，其实他召房玄龄和杜如晦回来，如果房杜真的回来了，那这两人当然是违抗了李渊的圣旨，但同时，李世民也违抗了李渊的圣旨。两人的意思非常明确，如果秦王您真的决心对抗，违抗圣旨，我们就回来跟您干，如果还像以前那样拿不定主意，像杨文干事件那样的情况再出现的话，倒霉的可是我们啊！
房杜二人的话，其实就是在询问李世民，是不是已经下定决心了！
想通了此节之后，李世民对尉迟敬德说，“不管圣旨如何，今天他们两人必须回到秦王府来，否则违抗圣旨是死，难道违抗我的命令就不是死吗？如果两人还不肯来，你就提他们的脑袋来！”
尉迟敬德领命后，火速赶往房玄龄、杜如晦的住处，对他们晓以利害关系，要求他们务必跟着自己回府议事。很快，房玄龄、杜如晦打扮成道士的模样，与尉迟恭分道进入秦王府。
房玄龄、杜如晦重回秦王府后，即刻劝说李世民应尽快铲除李建成、李元吉二人，并为他献上相应的计策。不久李世民率亲信埋伏在玄武门内，等到李建成、李元吉入朝之时，将二人射杀，此即历史上著名的“玄武门之变”。
政变之后，李世民成为太子，并且在不久后登基为帝。事后，李世民论功行赏，房玄龄进爵为邢国公，杜如晦进爵为蔡国公，两三年之后，两人便全都成为宰相，辅佐太宗奠定了“贞观之治”的基础。
