ggplot箱线图之如何添加最大值最小值线(whisker-ends)

ggplot作为R语言画图的瑞士军刀,相比于基础的R包,语法更加易于理解和掌握,不需要掌握很多的命令就能画出整洁美观的图表。比方说用ggplot来画箱线图,首先我们可以这样操作:

library(ggplot2)
library(RColorBrewer)
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy))
p + geom_boxplot(aes(colour=class),width=0.5)+
  theme(panel.background = element_blank(),axis.ticks=element_blank(),legend.position="none",axis.line = element_line(colour="black",arrow=arrow(length = unit(0.20, "npc"))))

得到下图

ggplot的箱线图

但是在基础R包绘制的箱线图和大部分的箱线图中是这样的
基础R包的箱线图

相比较于基础R包的箱线图,ggplot的箱线图缺少了最大值和最小值的两条须线(whisker-ends),于是我谷歌后找到了一个网页,参照网页中的操作,我在我的代码中加入了stat_boxplot,变成

library(ggplot2)
library(RColorBrewer)
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy))
p + geom_boxplot(aes(colour=class),width=0.5)+
  stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.15,aes(color=class))+
  theme(panel.background = element_blank(),axis.ticks=element_blank(),legend.position="none",axis.line = element_line(colour="black",arrow=arrow(length = unit(0.20, "npc"))))

加上须线后的box图

但是这样有一个问题,加上去的须线会挡住我们的box,显得图很乱,后来比照了前面的网页和我的代码,发现他的stat_boxplotgeom_boxplot前面,后来我想,之所以我的图会变成这样是因为ggplot是以图层的方式进行绘图,即后一个图层会覆盖前一个图层,因此我的代买里面先geom_boxplotstat_boxplot导致前面的box被后面的线覆盖掉,如果不想出现这种情况,那就只需要将这两个命令调整一下顺序,修改代码如下:

library(ggplot2)
library(RColorBrewer)
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy))
p + stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.15,aes(color=class))+
  geom_boxplot(aes(colour=class),width=0.5)+
  theme(panel.background = element_blank(),axis.ticks=element_blank(),legend.position="none",axis.line = element_line(colour="black",arrow=arrow(length = unit(0.20, "npc"))))
最终修改完的

最终总结:记住ggplot是基于图层的绘图系统。

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