转载:https://biozx.top/R-install-packages.html
从CRAN(https://cran.r-project.org/) 安装第三方包的方法:
>install.packages ("coefplot")
第二种:从bioconductor安装
从bioconductor(http://www.bioconductor.org/) 安装第三方包的方法:
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("limma")
> library(limma)
第三种:直接从Github上直接安装
直接从Github(https://github.com/) 上直接安装第三方包的方法:
- 安装合适版本的R软件,安装对应版本的Rtools,安装Rstudio,安装Miketex软件(这些软件均可从官网下载)。
- 打开R软件,选择镜像,安装“devtools”,具体可从R——程序包——安装程序包上进行,也可以使用''
install.packages("devtools")
'';还可以从CRAN上下载最新的程序包本地安装。(推荐最后一种) - 导入devtools包:''
library(devtools)
'' - 使用''
install_github("A","B")
'',其中A表示要从GitHub上安装的软件包的名称,B表示开发该程序包的作者,由于install_github默认B是“hadley”(即作者是“hadley”)。举个例子,mgarch包是vst开发的,则是''install_github("mgarch","vst")
''。或者''install_github("hadley/ggplot2")
#(user,包)''
第四种:从源码安装
先下载第三方包的安装包,
然后设置安装包存放的目录为当前目录''setwd('xxxx')''
然后运行''
install.packages("RCurl_1.95-4.8.tar.gz",repos = NULL,type = "source")
' 安装