高中生侦探工藤新一被神秘黑衣人下药，大难不死后发现身体竟然变小了!
小兰回家后，发现家里乱糟糟的，和醺酒的爸爸聊天，劝不要总是这样，没有工作上门不说，连妈妈也离家出走了。
新一雨中奔跑回家，却连自己家也进不去了，因为太高碰不到了。
小兰打电话到新一家无人接听，与父亲聊到新一的家庭，爸爸是小说家，而爸妈于三年前搬去美国，目前独居中，担心新一的小兰离家去找新一。
第一个知道新一被变小的人:阿笠博士。
博士隐私揭秘:现年52岁，是个作风迥异的发明家，虽自称天才，不过制造的东西都是破铜烂铁，而且屁股后的那颗痣还长了一根毛!
新一以超强的洞察力和分析力向博士证明了自己就是新一，不是奇怪的小鬼头。
终于回到家中的新一，在书房找到了上小学时的衣服，穿上正合适，红色领结，白衬衣，蓝色小西服，灰色短裤，很讲究的小新一。
博士告诉新一，如果被组织知道新一还活着，一定会再来，肯定会危害到身边的人，所以就当作两人之间的秘密，不能再告诉别人自己的真实身份了。
小兰来寻新一，变小的新一躲到了书桌后面，看到打开的抽屉里爸爸的眼镜，决定变装，因度数太高而取掉镜片，只余镜框。
小兰看到小身影，来到了书桌旁，看到了变装后的小新一，觉得好可爱的孩子，问名字的时候，新一灵机一动，看到书架上的书，脱口而出:江户川柯南，因为爸爸是柯南道尔的书迷。
新一以柯南的身份与小兰初相见!
为了寻找黑衣人的线索，在博士提议下，以这孩子的亲人因意外事故住了院，作为远房亲戚，拜托博士照顾，但是博士是单身汉的缘故，希望让柯南暂时到小兰家借住。
注意穿拖鞋的新一换鞋子喽！
柯南和小兰在回去的路上，聊到喜欢的人，新一以柯南的身份首次听到了小兰的表白:
没错!新一啊，从小就很调皮捣蛋，总是充满了自信，自以为自己是推理专家，不过，遇到急事拜托他，他就会勇气十足，变得好酷哦!我真的，好喜欢新一哦！
此时满脸通红的小新一，哦不，柯南。
毛利侦探事务所楼下，犹豫的新一有想要说出真相的冲动。
毛利小五郎叔叔飞奔下楼，接到了半年以来的第一份工作，有钱人家的女儿被绑架，据说绑架者是黑衣打扮的男子。
计程车上，一行三人，小兰向正在嘚瑟的爸爸介绍柯南。
报案人谷董事长，被绑架的是董事长女儿谷晶子，十岁，目击者麻生管家，毛利叔叔调查中，柯南被各种嫌弃。
在思索中踢球的柯南，让小兰想到了新一:新一在想事情的时候，也会踢足球哦，他说踢足球后，脑子就会变得清醒。
无意中惊动了看门犬巨无霸，看到陌生人都会叫的特性，证实了说谎的麻生管家，不过巨无霸和柯南一见很亲密。
这时，绑匪来了一通电话，让交三亿赎金，并穿出了晶子的话音，在某所看得到烟囱的学校里。事情并不简单，真的有人绑架了晶子。
为了找到晶子，柯南让神犬巨无霸出动，对，没错，史上第一次，我们的柯南君骑狗狂奔!
一路排除了看得到烟囱的学校也并未找到晶子，却在看到某栋楼的造型时恍然大悟，特殊的角度视觉，把大楼误认成烟囱，锁定学校，二桥中学!
柯南君一人一狗闯到，找到了晶子却没办法避开绑架犯，变小后的力量太小，脚力也不行，千钧一发之际，小兰赶到，小兰空手道的威力成功解决掉绑架犯！
事情解决，晶子向爸爸说起了串通管家说谎的行为，是为了让爸爸的公司关闭一段时间而来陪伴自己，谷董事长为了惩罚麻生管家，让其策划明天开始为期一周的旅行，目的地晶子最爱的澳洲，只两个人一起去。
临行前，晶子向柯南道谢:谢谢你，侦探先生!而受到董事长肯定及感谢的名侦探，此时是表情包!
回程，小兰提及留下柯南，叔叔思考一番，放言:没关系，没关系，这家伙来了之后工作就跟着来了，事情也很漂亮的解决了，就像是福神降临一样，所以说不要说是暂时，当我的儿子都行!
听到了没？新一!你岳父承认你了哦!
帝丹小学校:我是转学生，江户川柯南，请多多指教!
又要开始上小学了!（新一你可知二十年后你依旧在上小学!）
本集知识点:衣服前面淋湿，后面却没有，这就是在雨中奔跑的证据!
【本文作者：倾酱动漫集，原名倾轻雪
动漫集合地，打破次元壁，二次元一生推！
讲述二次元的欢乐喜悲，品味三次元的喜怒哀乐~】
