原来的官网已经停更了,安装包和手册都无法下载。
现仅存的安装包下载地址:philipan / cost733class-1.4 · GitLab (uni-augsburg.de)
手册:(2) (PDF) COST733CLASS v1.2 User guide (researchgate.net)
安装
因为我用的服务器,netcdf, hdf5等环境变量之前都是配置好的,所以解压后直接一步安装。
解压
tar xzvf cost733class-1.4.tar.gz
进入解压后的文件夹,执行
intel处理器 ./configure FC=ifort CC=icc --disable-grib --disable-opengl && make
gnu处理器 ./configure FC=gfortran CC=gcc --disable-grib --disable-opengl && make
然后进入src文件夹,检查是否生成cost733class可执行文件,生成即安装成功。
使用
关于方法以及类型的选择,更多的需要去读用户手册或者参考已发表文献,这里我只记录一下自己基于ERA5的逐小时SLP的运行流程
1. 数据下载
勾取自己需要的时间和经纬度范围,下载对应的nc文件
ERA5 hourly data on single levels from 1959 to present (copernicus.eu)
2. 数据预处理
根据自己的研究需求,可以用日平均,也可以每天挑选一个时刻,放在一个nc文件里
3. 运行
进入安装文件夹中的src文件,即cost733class可执行文件所在的位置,运行以下命令
./cost733class -dat pth:/public/home/sunxiaoyun/datadir/ERA5/input4cost733/slp-daily.nc slo:100:125:0.25 sla:20:50:0.25 -met PCT -ncl 4 -cla output-PCT.txt
./cost733class -dat pth:/student/sunxiaoyun/cal_4_cost733/input4cost733/slp-heavy.nc wgt:1.D0 -dat pth:/student/sunxiaoyun/cal_4_cost733/input4cost733/u-heavy.nc wgt:1.D0 -dat pth:/student/sunxiaoyun/cal_4_cost733/input4cost733/v-heavy.nc wgt:1.D0 slo:100:125:0.25 sla:20:50:0.25 -met PCT -ncl 4 -cla ./output/output-heavy-PCT04.txt #用地面气压和风场共同进行分型
执行时给出经纬度范围和分辨率,我选择的是PCT方法,类型是4种,输出至PCT.txt,这些都可以根据自己的需求进行修改。
到这一步就可以出运行结果了,生成的txt中几列数据分别是年,月,日,时和type
4.分类结果评估
手册中提供了一些分类结果评估的,目的是选出最合适的类型数。这里举例最常用的方法止一:ECV
需要给出分类的input文件,分类的执行结果以及方法的选择。
./cost733class -dat pth:/student/sunxiaoyun/cal_4_cost733/input4cost733/slp-heavy-twice.nc -clain pth:./output/output-heavy-twice-PCT04.txt dtc:4 ddt:1d -met ECV -idx clain-ECV
其中 dtc:4 (日期数据有四列的意思)这个命令需要加上,否则在读入分类结果的时候会报错。
其中关于分类及评估方法的选取,以及用多种变量分类时权重的分配等都有待研究。感兴趣的可以自己去手册里看看。手册中还提供了后处理的一些命令,我用不惯,选择自己画图分析了。
遇到的问题(好多问题/(ㄒoㄒ)/~~)及解决方案:
1. 关于input文件的时间单位
直接下载的数据去运行cost733报错,找不到时间单位,但数据属性显示明明是有单位的
然后我去研究了一下代码,发现对时间单位的几种情况中,开始时间没有1900-01-01 00:00:00.0这种情况,不敢随意修改源代码怕有连锁反应,也不想通读所有代码,所以就写了个脚本改了一下时间属性(这一步自行发挥,我目前试了ncl和python都可以)。
更改后的时间单位如图所示,是代码中显示的第三种case。然后我去试了一下就可以正常运行了。
2. input文件时间的连续性
这个分型模式只适用于连续的日期进行分型,例如我输入的是2013-2020年每年的12月共8个月的数据,最后运行完输出的txt文件中显示从2013年12月1日到2014年7月。目前找到的解决方案就是再另写一个文件记录正确的日期,最后分析的时候替换一下。
3.input文件日平均的处理
在我自己运行的时候,分析的时间序列比较长,所以用日均值比较合理。ERA5官方有提供一个calculator Daily statistics calculated from ERA5 data (copernicus.eu),需要点点点,我选择了python批量下载小时值,用cdo处理成日均值。cdo的安装和使用我也进行过一些简单的记录。
安装: 基于anaconda安装cdo - 简书 (jianshu.com) 使用:cdo的使用--数据的合并,剪裁,更改等,持更 - 简书 (jianshu.com)
但是回来就发现这个cdo做的日均值在跨年数据作为input文件的时候会报错。就是我用2013-2020年每年的12月共8个月没问题,做每年冬季(12月-次年1-2月)就会报错方差为0。方差为0不就是数据都一样吗,又去检查了所有数据的方差明明没有0,无法理解。
评论区有朋友说删除使用cdo平均过程中新生成的time_bnds后可正常运行,我试了一下还是失败了,有需要的朋友可以尝试一下。
2023.02.10更新
原来执行./cost733class 命令可以选择读入的变量! 这样便可以解决方差为0的问题。
./cost733class pth:/public/home/sunxiaoyun/datadir/ERA5/input4cost733/slp-daily.nc var:z slo:100:125:0.25 sla:20:50:0.25 -met PCT -ncl 4 -cla output-PCT.txt
2023.08.04更新
使用cdo的delete删除time_bnds变量总是报错找不到变量
用了python中del命令,变量依旧存在。。。
最后实现工具大融合,最终用nco删除了这个变量
ncrcat -v varname -x input.nc output.nc
2024.05.23更新
模式默认读取日数据,在做一天多个时次的时候可以尝试更改一下nc文件的时间间隔,也可解决方差为0的问题
cdo settaxis, 2013-04-01, 00:00, 1 day test.nc test1.nc