1. 基因DNA分为编码区和非编码区，编码区包含外显子和内含子，一般非编码区具有基因表达的调控功能，如启动子在非编码区。编码区则转录为mRNA并最终翻译成蛋白质。外显子和内含子都被转录到mRNA前体hnRNA中，当hnRNA进行剪接变为成熟的mRNA时，内含子被切除，而外显子保留。实际上真正编码蛋白质的是外显子，而内含子则无编码功能。 内含子存在于DNA中，在转录的过程中，DNA上的内含子也会被转录到前体RNA中，但前体RNA上的内含子会在RNA离开细胞核进行翻译前被切除。
2. 外显子拼接形成成熟的mRNA，多数基因都有UTR,它们也是外显子拼接的产物，所以，你会发现mRNA的长度要大于CDS，只有CDS才编码蛋白，AUG以前的mRNA编码前导序列。因此可以这么理解，外显子并不一定全部编码蛋白质，成熟mRNA的UTR也可以是外显子，外显子就是RNA剪接后留下的部分。外显子与CDS区不是完全一致的，CDS区一定属于外显子，但是外显子不一定是CDS区，也就是说外显子不一定都能翻译成蛋白的。
3. mRNA包括UTR和CDS！内含子（intron）是断裂基因中外显子之间的间隔序列（intervening sequence，IVS），可参与前体RNA的转录，但其转录的RNA序列于转录后的加工中被切除，不包括于成熟的RNA分子中。外显子（exon）在断裂基因中，转录成熟RNA中相应序列的DNA片段。内含子和外显子的分界线在于：GU-AG法则。即每个内含子的开始两个碱基都是是GU（或GT），最后两个是AG。
真核生物基因结构图
