今天学习了linux环境下的软件安装。
- 1、了解linux的应用商店：conda
conda是大Boss，最初为管理python包而建立，它是一个大的涵盖许多领域的软件包管理器。anaconda是总管，职务比conda低，但干的活不少，也是个有内涵的家伙。miniconda是区域经理，说白了就是干事的，而且比较专一，主要负责生信领域。 - 2、下载Miniconda
百度/谷歌搜索“miniconda 清华”（是清华的conda镜像网站），网址：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/，根据服务器的版本下载对应版本。可以在服务器中输入命令uname -a查看。 - 3、安装和配置Miniconda
登陆服务器，进入biosoft目录，输入命令wget 下载链接（如wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh），回车，安装包就下载好了。
输入命令bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ，回车，进行软件安装。然后就开始了安装过程，中间会出现很多的版权信息，按回车跳过它们
当你看到一行“Do you accept the license terms? [yes|no]”说明安装要开始了【注意看下图的操作，程序让你enter就enter，让你yes就yes】
安装成功
还需要输入命令 source ~/.bashrc 来激活conda。
激活成功
安装有问题，可以参考演示视频【无声版】
链接：https://share.weiyun.com/5J82l9g 密码：iwcd4k
所谓镜像网站，相当于主网站的副本，conda在国外，我们在国内下载软件速度会很慢，因此配置镜像，从镜像网站下载，可以加快下载速度。
把下面的代码全部复制到命令行，粘贴、回车
镜像网站 - 4、使用Miniconda，即查看已安装的软件、搜索、安装、卸载（生信需要的）软件
- （1）输入命令 conda list：查看当前所有软件列表
- （2）输入命令 conda search 软件名称：搜索软件
- （3）输入命令 conda install 软件名称 -y：自动安装软件【加上-y是自动安装】
- （4）输入命令 conda remove 软件名称 -y：卸载软件
小结：今天安装和配置Miniconda软件的时候出现了一种问题：问题
原来是有一个地方写成了No。错误位置
解决方法：输入命令cd，重新返回到主目录；输入命令rm -r biosoft，删除文件biosoft；输入命令mkdir biosoft，新建biosoft文件；输入命令 cd biosoft，进入biosoft文件，最后重新下载安装Miniconda即可。
