数据结构
向量(Vector)
- 定义:向量是一组有序排列的元素,元素类型可以是数字或者字符串
- 向量的赋值
x<- c(1,2,3) 常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量
x<- 1:10 从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) 1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x<- rep(1:3,times=2) 1-3 重复2次
- 从向量中提取元素
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
数据框(Data frame)
- 读取本地数据
read.table(file="huahua.txt",sep = "\t",header =T)
a<-read.table(file="huahua.txt",sep = "\t",header =T)
- 设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
- 数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F) 分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
- 变量的保存与重新加载 (学会保存和重新加载,保存的格式是RData)
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
- 提取元素
- X[x,y] 第x行第y列
- X[x,] 第x行
- X[,y] 第y列
- X[y] 也是第y列
- X[a:b] 第a列到第b列
- X[c(a,b)] 第a列和第b列
- X$列名 也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,支持Tab自动补全)
矩阵(Matrix)
数组(Array)
List
Q:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错X not found,是为什么,应该怎么解决?
A: 可能变量X大小写输错;输入小写x试一下。