学习小组Day4笔记- 邬阳

生信星球学习Day4

R语言基础

一、R和Rstudio的安装

1.Windows系统

1.1 下载R
https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/bin/windows/base/R-4.0.5-win.exe
1.2 下载rstudio
https://download1.rstudio.org/desktop/windows/RStudio-1.4.1106.exe
1.3 安装
要确定安装路径是纯英文:

确定英文路径.png

2.Linux系统
#安装R
conda install r-base

#下载rstudio
wget https://download1.rstudio.org/desktop/bionic/amd64/rstudio-1.4.1106-amd64.deb

#安装gdebi
 sudo apt install gdebi-core

#安装rstudio
sudo gdebi rstudio-1.4.1106-amd64.deb

#在Linux上运行rstudio需要进入 miniconda/lib文件夹,并激活base环境。不知道什么原因,反正不这样就会出现各种问题。。

cd ~/miniconda3/lib
source activate base

#启动rstudio
rstudio

二、R启动界面和基本操作

2.1Rstudio 启动界面


R界面.png

2.2 基本操作

#显示文件列表
> dir()
[1] "text.Rproj"
> list.files()
[1] "text.Rproj"

#加减乘除
> 1+2
[1] 3


#赋值
> x<-1+2
> x
[1] 3

#删除变量
> a<-3
> b<-1
> c<-4
> u<-5+6
> rm(b)
> b
错误: 找不到对象'b'
> u
[1] 11
> rm(u,c)
> u
错误: 找不到对象'u'
> rm(list = ls())#清空所有变量
> ls()
character(0)

#列出历史命令
> history()

#清理控制台
ctrl+l

2.3 简单画图

#散点图
> plot(rnorm(50))
Rplot01.png
#箱图
>boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
Rplot02.png
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