生信学习小组Day4--康康

今天开始学习R语言啦

1. R和Rstudio

1.1 R是什么

(1)R是一种编程语言,汇集了许多函数,能够提供统计、绘图等若干功能

(2)R语言软件界面简单,通常使用Rstudio来操作

1.2 Rstudio是什么

通俗的理解是R的可视化,它是R的操作平台

注:查看你的电脑用户名是中文还是英文(这一步特别特别重要,一定要做)
先在电脑桌面随便打开一个文件夹

image.png

image.png

如果是英文,就可以直接进行安装了,如果是中文,必须改为英文,否则无法安装
我的是英文,没有进行这一步操作,如果你的是中文,在此安利一下大神的教程

来自:生信星球
当Rstudio杠上中文用户名

2. 下载R和Rstudio

2.1 下载R

通过网址 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

image.png

选择对应自己电脑的版本
image.png

image.png

然后就是下载后安装

2.2 下载Rstudio

通过网址 https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/

image.png

image.png

选择自己需要的版本下载安装即可

3. 认识Rstudio

3.1 Rstudio界面

image.png

认识完界面,试练一下
(1)在脚本编辑区输入plot(rnorm(50))
plot:plot()函数是R中基本的画x-y两个变量的函数
runif函数:随机分布函数
image.png

(2)在脚本编辑区输入boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col = c("lightblue","lightyellow","lightpink"))
image.png

注:iris是一个R语言自带的数据框,通常用作示例。iris$Sepal.Length表示iris数据框的Sepal.Length这一列数据

3.2 Rstudio显示设定

操作流程:Tools—Global Options—Appearance—Editor font size—Apply

image.png

4. R语言的基本用法及操作

4.1 用Rproject管理工作目录

设置工作目录:setwd()

查看工作目录:getwd()

所谓工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到
引用:https://m.umu.cn/session/article/29dNB82ec?fwx=1
R只能对应一个工作目录,但如果遇到多个项目,需要对应多个工作目录,R project就很有必要了
R可以同时打开多个Rproj文件,他们处于多个独立的Rstudio界面中,不会相互影响。如果仅仅创建R脚本,不创建Rstudio项目,则不同的R脚本只能处于同一个Rstudio界面中,共享一个工作路径,也共享环境变量,可能相互影响,这时两个R脚本不能同时运行
引用:https://bookdown.org/xiao/RAnalysisBook/r.html

微信图片_20200421000443.png

微信图片_20200421000730.png

新建成功

4.2 显示文件列表

代码:dir()

4.3 基本运算

微信图片_20200421002513.png

4.4 对变量进行赋值

赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号
x<- 1+2 意思是把1+2的运算结果赋值给x, 赋值后,x会显示在右上角的框,Environment里的Value列表里
直接输入x 回车,就会把x的值(3)打印到控制台上,前面的那个[1]是结果的第一个,不用管他

引用:https://m.umu.cn/session/article/29dNB82ec?fwx=1

微信图片_20200421003343.png

4.5 删除变量

清除单一变量:rm(变量名称)

清除多个变量:rm(变量1,变量2)

一键清空批量删除:rm(list = ls())#清空所有变量(此时右侧Enviroment就空了)

4.6 列出历史记录

history()相当于鼠标单击右上角的history标签

4.7 清空控制台

Ctrl+L

注:一定一定要在英文输入法下输入命令行中的符号

最后附一张思维导图

R语言基础.png
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 206,602评论 6 481
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 88,442评论 2 382
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 152,878评论 0 344
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 55,306评论 1 279
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 64,330评论 5 373
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 49,071评论 1 285
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 38,382评论 3 400
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 37,006评论 0 259
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 43,512评论 1 300
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,965评论 2 325
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 38,094评论 1 333
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,732评论 4 323
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 39,283评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 30,286评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,512评论 1 262
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 45,536评论 2 354
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,828评论 2 345

推荐阅读更多精彩内容