金庸的小说里，九阴真经像是个引子，贯穿于从《射雕英雄传》到《倚天屠龙记》等多部小说。
《射雕英雄传》中，相传九阴真经是两宋时期一个叫黄裳的人所创，流于世上之后为武林各大高手所觊觎，后中神通王重阳提出华山论剑，于是同黄药师，欧阳峰等人之间有了一场华丽丽的比武。王技高一筹终于得到了九阴真经，将其刻在石壁上，并在自己弥留之时将经书留给了师弟老顽童周伯通。岂知周伯通这憨货中了黄药师的计，把经书交给黄的老婆一看，黄夫人有过目不忘的本领，于是九阴真经有了复写本。后来复写本的半部被黄药师的弟子梅超风和陈玄风所盗，练了其中一部分武功成为江湖上的黑白双煞。在《射雕英雄传》中九阴真经最后还是误打误撞到了傻人有傻福的郭靖手里，郭靖本不想练，被周伯通用激将法学会了九阴真经。这就叫作是你的终是你的，不是你的，费劲心思也还是得不到。天意弄人，欧阳锋为了得到九阴真经死了亲生儿子，最后练功走火入魔，几近失常，真真的一入武林终身毁，功名利禄都成空。
《神雕侠侣》是和《射雕英雄传》联系最紧密的一部，虽不至于是承袭射雕来的，但故事确实围绕射雕而展开。大概金庸觉得在射雕中把郭靖的拜把兄弟杨康写成贪图荣华富贵，背信弃义的小人有点不忍心，于是将杨康的儿子写成至情至性的绝世奇葩，至于这绝世奇葩，当然要有九阴真经的庇护了。在射雕中，王重阳将九阴真经刻在了石壁上，这石壁正是小龙女所在的古墓派的石壁。想当年，王重阳与古墓派创始人林朝英相恋，却没能有个结果，林抱恨而死，林死后，王重阳进入古墓，发现了林所创的玉女心经，于是将九阴真经中能破解玉女心经的部分刻在了石壁上。这是件好玩的事情，凡大侠，江湖高手，势必会碰到在情与义间进行抉择的极端恶劣情况，幸亏有杨过这样的当世奇葩，不顾所谓的伦理道德，和自己的师父谈恋爱，什么姐弟恋，忘年恋，不伦恋，你说属于哪种恋它就属于哪种恋，前卫夸张很时尚。必须的，九阴真经不出意外的被杨过习得，并且杨过将自己的绝学黯然销魂掌加入其中（瞧这名字，多洋气），锦上添花，九阴真经的武功更加的完善与完美。所以说，人这辈子能成功，得有机遇，还得想别人不敢想，做别人不敢做，杨过要是不认识小龙女他能碰到真经吗？机遇有了，做也做了，还得有创新，否则天下第一的东西学的人多了以后也就不足为奇了。试想，郭靖的后代肯定都会几下九阴真经，代代相传下去，九阴真经成了健身操一样的东西也不是没有可能的。
九阴真经的下一站是《倚天屠龙记》，它是如何跑到倚天屠龙当中去的呢？原来当年郭夫人黄蓉把九阴真经的精华写到一张纸上藏进了倚天剑，给了女儿郭襄，也就是后来的峨嵋创派掌门人。 只要拿倚天剑屠龙刀互劈就能找到黄蓉的九阴真经手抄本。芷若姑娘知道了，并最终互劈成功（二虎相争必有一伤，想来兵器也是如此，而且不是一伤，而是俱毁），练得了九阴真经中的九阴白骨爪。因为芷若姑娘学的乃是精华本，并且她根基不够，终于还是被张无忌用九阳神功打败，九阴真经也从此落入了张无忌的手中。小姑娘舞刀弄枪的本来就不好，而且出发点就不对，学成之后一掌把人吸成个骷髅，胆子真够大，就不怕晚上做噩梦，还是把路走偏了。所以，即使是同一门本领，因为个人的领悟能力不同，掌握的情况就有差异。单只是差异性还好了，比方说人们发现了核能之后，有人研究用它来发电，有人研究用它来做大规模杀伤性武器。东西本身没问题，看取它的人安的什么心，心若歪了，学的也就歪了，只有人心有正邪，这个世界是无暇的。
